Ik voer metagenomics, microbiome, rna seq analyse uit
Expert bioinformaticus, NGS, RNA Seq en metagenomics analyse
Over deze dienst
Ik voer deskundige bioinformatica, RNA-Seq, scRNA-Seq, Metagenomics & NGS data-analyse uit.
Als professionele bioinformaticus lever ik hoogwaardige, reproduceerbare analyses voor onderzoek, academische en industriële projecten. Of je nu ruwe sequencing data hebt of diepgaande biologische inzichten nodig hebt, ik zet je data om in duidelijke, publicatieklare resultaten.
Services omvatten:
- Bulk RNA-Seq & Single-cell RNA-Seq (scRNA-Seq) analyse differentiële genexpressie, clustering, padway-enrichments
- Metagenomics & Microbiome analyse (16S rRNA, ITS, shotgun metagenomics, taxonomische profiling & diversiteitsanalyse)
- NGS / WGS data verwerking, variant calling & annotatie
- Genexpressie analyse, transcriptomics & functionele annotatie
Tools & Technologieën:
- R / Bioconductor: DESeq2, edgeR, Seurat, clusterProfiler, limma
- QIIME2, Mothur, Kraken2, MetaPhlAn
- Python: Scanpy, Pandas, Biopython
- Alignering & QC tools: FastQC, Trimmomatic, STAR, HISAT2
Deliverables:
- Volledige kwaliteitscontrole- en preprocessing-rapporten
- Publicatieklare figuren en visualisaties (heatmaps, vulcanoplots, PCA, fylogenetische bomen, etc.)
- Uitgebreid HTML/PDF-rapport met statistische resultaten en biologische interpretatie
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke soorten data accepteer je?
Ik accepteer ruwe en verwerkte sequencing data, inclusief FASTQ, BAM, FASTA, count matrices, enzovoort, voor RNA-Seq, scRNA-Seq, Metagenomics en NGS projecten.
Wat zit er bij de uiteindelijke levering inbegrepen?
Je ontvangt een compleet pakket: publicatieklare figuren, gedetailleerd HTML/PDF-rapport met statistische resultaten, biologische interpretatie, alle verwerkte bestanden en methodesectie geschikt voor onderzoeksartikelen.
Zijn mijn data en projectgegevens vertrouwelijk?
Absoluut. Ik behoud volledige vertrouwelijkheid en deel je data nooit met anderen. Ik kan ook een NDA ondertekenen indien nodig.
Ik weet niet zeker welk pakket geschikt is voor mijn project. Wat moet ik doen?
Stuur me gewoon een bericht met je projectgegevens (aantal monsters, datatypes en doelen). Ik beoordeel ze en adviseer je over het beste pakket met een op maat gemaakte offerte.
Levert u revisies aan?
Ja. Basis bevat 1 revisie, Standaard 2, en Premium 3 revisies. Extra revisies zijn beschikbaar als Gig Extras.
Welke soorten analyses kun je uitvoeren?
Ik kan differentiële genexpressie, clustering, padway-analyse, taxonomische profiling, diversiteitsanalyse, kwaliteitscontrole en meer uitvoeren voor RNA-Seq, scRNA-Seq, metagenomics en NGS data.
Welke diensten bied je aan onder deze gig?
Ik bied deskundige bioinformatica analyse voor RNA-Seq, scRNA-Seq, Metagenomics, Microbiome en NGS data projecten.

