Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik voer bioinformatica analyse van microbiome data uit
Bioloog Statistische Analyse en Bioinformatica
Ik ben bioloog en onderzoeker met specialisatie in statistische analyse, bioinformatica, microbiologie en microbieel ecologie. Ik werk met R, DADA2, QIIME2, Phyloseq en QGIS om biologische en milieuge...
Over deze dienst
Hulp nodig bij het analyseren van microbiome- of microbial amplicon data? Ik kan je helpen met het verwerken, analyseren en interpreteren van je data met behulp van QIIME2, DADA2, Phyloseq en R.
Ik kan werken met 16S rRNA en andere microbial amplicon datasets en bied:
- QIIME2/DADA2 data verwerking en kwaliteitsbeoordeling
- Taxonomische samenstelling en diversiteitsanalyse
- Alpha- en beta-diversiteit
- Ordinatie en gemeenschapsstructuur analyse
- Statistische analyse en visualisatie
- Differentiële abundantie analyse indien relevant
- Publicatieklare figuren en duidelijke interpretatie
Je ontvangt: verwerkte resultaten, statistische outputs, duidelijke figuren, interpretatie van bevindingen en reproduceerbare analyse-workflows indien deze in je pakket zijn inbegrepen.
Ik richt me op het kiezen van de juiste methoden op basis van jouw onderzoeksvraag, experimenteel ontwerp en datastructuur.
Neem contact met me op voordat je bestelt als je niet zeker weet welk pakket geschikt is voor jouw dataset of als je een specifieke bioinformatica workflow nodig hebt.
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke soorten microbiome data kun je analyseren?
Ik kan microbial amplicon datasets zoals 16S rRNA data en andere compatibele microbiome datasets analyseren met QIIME2, DADA2, Phyloseq en R. Neem contact met me op voordat je bestelt als je een ander datatypes hebt.
Kun je ruwe FASTQ-bestanden analyseren?
Ja. Afhankelijk van het pakket kan ik werken met ruwe FASTQ-bestanden en kwaliteitsbeoordeling en verwerking uitvoeren met QIIME2 of DADA2. Geef informatie over je sequencing platform, primers en experimenteel ontwerp.
Kun je mijn microbiome data analyseren als ik niet weet welke methode ik moet gebruiken?
Ja. Ik kan je onderzoeksvraag, experimenteel ontwerp, metadata en datastructuur bekijken en een passend analyseworkflow aanbevelen.
Ontvang ik de analysecode?
Reproduceerbare code kan worden meegeleverd, afhankelijk van het pakket. Ik kan R-scripts en relevante analyse-workflows bieden wanneer dat mogelijk is.
Kun je publicatie-waardige figuren maken?
Ja. Afhankelijk van het pakket kan ik duidelijke en publicatieklare figuren maken voor diversiteit, taxonomie, ordinatie, gemeenschapsstructuur en andere relevante analyses.
Kun je differentiële abundantie analyseren?
Ja, wanneer het experimenteel ontwerp en de data dat ondersteunen. De juiste methode hangt af van het studieontwerp, aantal monsters, metadata en onderzoeksvraag.
