Ik voer bioinformatica en computationele biologie analyse uit
Ik voer bioinformatica, computationele biologie en systeembiologie analyse uit
Over deze dienst
Ph.D. Bioinformaticus & Computationeel Systeembioloog met meer dan 10 jaar ervaring. Ik vertaal complexe biologische data naar reproduceerbare, publicatieklare inzichten met behulp van AI, Machine Learning en HPC. Ik heb meer dan 20 peer-reviewed Q1/Q2 artikelen geschreven en onderzoek gedaan in Maleisië, Japan en de VS.
Mijn diensten:
AI & ML: Aangepaste modellen met Python, TensorFlow, PyTorch en scikit-learn.
Multi-Omics & Systeembiologie: Integratie van transcriptomics, proteomics en metabolomics. Netwerkbiologie en padreconstructie (Cytoscape, STRING, KEGG).
HPC & Modellering: Constraint-based modellering (FBA, COBRApy) en grootschalige simulaties.
Bioproces: Modellering en optimalisatie van fermentatie en PHA-productie.
Pipelines: Workflow-automatisering met Docker, Snakemake en Nextflow.
Mijn pakketten:
BASIS: Standaard bioinformatica, statistische analyse en publicatieklare figuren. Inclusief projectreview.
STANDAARD: Multi-omics integratie, netwerkbiologie en machine learning. Inclusief modelcontrole.
PREMIUM: Geavanceerde AI, HPC-simulaties en bioprocesoptimalisatie. Inclusief uitgebreide modelcontrole en ondersteuning bij manuscriptmethoden.
Neem contact op voordat je bestelt
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Q1: Bied je de ruwe code en scripts die voor de analyse gebruikt worden?
A: Ja, absoluut. Voor de pakketten Standaard en Premium lever ik alle aangepaste Python-, R- of Shell-scripts. Ik bied ook reproduceerbare pipelines met Docker of Snakemake op verzoek, zodat je computational werk volledig transparant en reproduceerbaar is voor toekomstige publicaties.
Q2: Kun je me helpen de Computationele Methoden-sectie voor mijn manuscript te schrijven?
A: Ja. Met meer dan 20 peer-reviewed Q1/Q2-publicaties heb ik ruime ervaring in academisch schrijven. Het schrijven van de methoden-sectie is inbegrepen in het Premium pakket. Als je een Basic of Standaard pakket hebt besteld, kun je "Manuscript Methoden Schrijven" als Gig Extra kopen.
Q3: Wat heb ik nodig om te beginnen met de bestelling?
A: Om nauwkeurigheid te garanderen, heb ik je ruwe dataset (CSV, FASTQ, etc.), een korte beschrijving van je experimenteel ontwerp en je specifieke onderzoeksdoelen nodig. Voor Modelcontroles, lever de bestaande modelbestanden (bijvoorbeeld SBML, XML of Python-scripts).
Q4: Bied je ondersteuning nadat de opdracht als voltooid is gemarkeerd?
A: Ja. Ik wil dat je volledig tevreden bent. Ik bied 7 dagen gratis ondersteuning na levering voor bugfixes of kleine verduidelijkingen over het geleverde werk. Voor nieuwe analyses of uitgebreide onderzoeksvragen is een nieuwe opdracht of Gig Extra nodig.
Q5: Kunnen we een live vergadering hebben om mijn project te bespreken voordat ik bestel?
A: Ja. Ik bied een live consult van 15 minuten in het Basic pakket en 30 minuten in de Standaard en Premium pakketten via Zoom of Google Meet. Als je je project wilt bespreken voordat je bestelt, stuur me dan een bericht en we regelen een korte eerste kennismaking.
Q6: Wat is het verschil tussen een "Project Review" en een "Model Audit"?
A: Een Project Review (Basic) is een beoordeling van je dataset en experimenteel ontwerp om te zorgen dat het geschikt is voor de gevraagde analyse. Een Model Audit (Standaard/Premium) is een diepgaande technische beoordeling van je bestaande computationele modellen.
Q7: Wat als mijn data privé is of onder een Non-Disclosure Agreement (NDA) valt?
A: Ik houd me strikt aan data privacy en vertrouwelijkheid. Ik ben bereid een NDA te ondertekenen voordat je gevoelige data deelt. Alle data wordt veilig verwerkt op mijn lokale werkstations of beveiligde cloud-omgevingen en wordt verwijderd na afronding van het project indien gewenst.
Q8: Bied je spoedlevering aan?
A: Ja. Je kunt de "Extra Fast Delivery" Gig Extra selecteren bij het afrekenen. Houd er rekening mee dat vanwege de uitgebreide verwerkingstijd voor geavanceerd computationeel onderzoek, spoedbestellingen onderhevig zijn aan een toeslag en afhankelijk zijn van mijn huidige workload. Neem eerst contact op om beschikbaarheid te bevestigen.

