Ik voer RNA seq differentiële expressie analyse en deseq2 plots uit
Bioinformatics Analist RNA Seq, Moleculaire Docking en MD Simulaties
Over deze dienst
Welkom bij mijn Computational Biology & Transcriptomics Service!
Ben je op zoek naar nauwkeurige, publicatieklare RNA-Sequencing (RNA-Seq) data-analyse? Ik bied end-to-end transcriptomische pipelines met behulp van industry-standard computational biology tools in Linux Bash, R en Python.
Diensten die ik aanbied:
Quality Control & Trimming (FastQC, Trimmomatic)
Splice-aware Read Alignment (HISAT2)
Gene Quantification (featureCounts)
Differentiële genexpressie analyse (DESeq2 in R)
Hoge-resolutie visualisaties (Volcano plots, gegroepeerde heatmaps, PCA)
Functionele verrijkingsanalyse (GO & KEGG pathway analyse)
Wat je ontvangt:
1. Schoongemaakte datasets & geannoteerde Excel-tabellen van DEGs met fold changes en aangepaste p-waarden.
2. Hoogwaardige (300+ DPI) vector/PNG plots klaar voor publicatie.
3. Reproduceerbare, goed commentaar gegeven R-bronscripts.
4. Samenvattend analytisch PDF-rapport.
Neem contact met me op voordat je een bestelling plaatst om de grootte van je dataset en projectvereisten te bespreken!
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke invoerbestanden moet ik aanleveren?
Je kunt ruwe FASTQ-bestanden aanleveren of een gen-tellingmatrix samen met je experimenteel ontwerp (Control vs Behandelde monsters).
Ontvang ik reproduceerbare R-code?
Ja, volledige en goed gedocumenteerde R-scripts met commentaar worden geleverd in de standaard- en premium-pakketten voor volledige transparantie en reproduceerbaarheid.

