Ik voer NGS data QC, trimming en alignment uit met Galaxy

Wil je hulp bij het verwerken van je ruwe NGS sequencing data? Ik bied betrouwbare quality control, trimming en alignment met behulp van het Galaxy platform, zodat je schone, analyse-klare data krijgt zonder zelf de pipeline te hoeven leren.

Wat ik kan doen:

Sequencing data ophalen van NCBI/SRA (fasterq-dump)

FastQC uitvoeren voor kwaliteitsbeoordeling

Reads trimmen en schoonmaken (Trimmomatic)

Reads aligneren op een referentiegenoom (Bowtie2, HISAT2)

Een duidelijke samenvatting van de resultaten geven

Ik werk ook met verschillende andere Galaxy tools naast deze, als je project iets specifieks nodig heeft, stuur me eerst een bericht en ik bevestig of ik kan helpen.

Ik ben nog vroeg in mijn freelance-reis, met praktische ervaring in NGS QC, trimming en alignment, een goede optie voor eenvoudige projecten tegen een betaalbare prijs.

Let op: Het is het meest geschikt voor kleine tot middelgrote datasets (bijvoorbeeld targeted sequencing, small RNA-seq experimenten). Voor zeer grote datasets, stuur me eerst een bericht om de haalbaarheid te bevestigen.

Stuur me je datasetgegevens (organisme, sequencing type, bestandsgrootte) voordat je bestelt, dan bevestig ik de doorlooptijd.