Welkom bij jouw professionele CADD & Computational Biology oplossing!
Ben je op zoek naar een ervaren onderzoeker die betrouwbare in silico drug design, moleculair docking of geavanceerde moleculaire dynamica simulaties kan uitvoeren voor jouw academische papers of biotech projecten? Je bent op de juiste plek.
Met uitgebreide praktische ervaring in bioinformatics workflows lever ik data van hoge kwaliteit, klaar voor publicatie, en uitgebreide structurele analyses.
Diensten die ik aanbied:
- Target & Ligand Voorbereiding: Structuur ophalen uit PDB, schoonmaken en receptor/ligand bestanden voorbereiden.
- Actieve Site Voorspelling: Geavanceerde binding pocket identificatie met geoptimaliseerde tools zoals P2RANK.
- Moleculair Docking: Hoogwaardige virtuele screening en binding affiniteit berekeningen met AutoDock Vina.
- Interacties Profilering: Gedetailleerde 2D en 3D interactie mapping (Waterstofbruggen, hydrofobe interacties) via PLIP.
- Moleculaire Dynamica (MD) Simulaties: Productie runs uitgevoerd via GROMACS op een native Linux omgeving om thermodynamische complex stabiliteit te beoordelen (RMSD, RMSF, Rg, H-bruggen analyse).
- ADMET & Drug-Likeness: Volledige farmacokinetiek, toxiciteit profiel en Lipinskis Rule of Five beoordeling met SwissADME en ADMETla.