Ik doe bioinformatica genomica proteomics evolutie

Heb je moeite met het gebruiken van de ruwe sequencing data om biologische betekenis te krijgen?

Ik heb ruime ervaring als bioinformaticus en kan alle benodigde data-analyse voor jouw onderzoek op een uitgebreide en publicatieklare manier verzorgen. Als academisch wetenschapper, biotech start-up of medisch professional werk ik met jouw data met de grootste precisie, met industrienorm pipelines en state-of-the-art tools.

Wat ik aanbied:

Next-Generation Sequencing (NGS) analyse: Bulk RNA-Seq, Single-Cell RNA-Seq (scRNA-Seq), differentiële genexpressie (DGE) analyse.

Genomica - DNA-Seq, variant calling (SNPs/Indels) en genome-assemblage.

Epigenomics - ChIP-Seq en ATAC-Seq analyse.

Microbiome & Metagenomics: Taxonomische profiling, functionele annotaties, 16S rRNA sequencing.

Geavanceerde data visualisatie: Hoogwaardige, publicatieklare grafieken (Volcano plot, Heatmap, PCA, Pathway/GO Enrichment netwerk, en TSNE/UMAP plots).

Gespecialiseerde analyse met R (Bioconductor), Python: Aangepaste scripting & pipelines.

De tools die ik gebruik:

Data alignering & QC: FastQC, Trimmomatic, STAR, HISAT2, BWA, SAMtools.

Quantificatie & DGE: DESeq2, EdgeR, K