Ik doe moleculaire docking, gnina, autodock vina en pymol interactieanalyse

Sommige informatie is automatisch vertaald.

Pakistan

Ik spreek Engels

1 bestelling voltooid

PhD chemicus, cheminformatica en analytisch expert

PhD chemicus met meer dan 15 jaar onderzoek en onderwijs ervaring. Ik ben gespecialiseerd in het verbinden van experimentele lab data met moderne computational workflows. Mijn expertise omvat: • Chem...
Over deze dienst

Heb je nauwkeurige, publicatie-klare moleculaire docking nodig voor je onderzoek of drug design project? Ik bied computationele chemiediensten aan met AutoDock Vina en GNINA (diep-leer CNN scoring), gecombineerd met gedetailleerde interactieprofilering.

Wat ik aanbied:

  • Target & Ligand Voorbereiding: Structuurherstel, ladingtoewijzing, protonatie op fysiologische pH, en energieminimalisatie.
  • Moleculaire Docking: Grid box optimalisatie (actieve site of blind docking) met AutoDock Vina en GNINA voor betrouwbare affiniteitsschattingen (kcal/mol).
  • Interactieprofilering: Hoogresolutie 2D-kaarten via BIOVIA Discovery Studio (H-bronnen, pi-stacking, zoutbruggen) en 3D-ray-traced visuals in PyMOL.

Leveringen:

  • Docked complex bestanden (.pdb, .pdbqt, .sdf)
  • Volledig bewerkbare PyMOL sessie (.pse)
  • Hoge-resolutie 300+ DPI figures klaar voor publicatie
  • Samenvattingstabel van bindingsenergieën en belangrijke residue-contacten

Waarom ik?

  • Methodologisch rigoureuze workflows volgens peer-review standaarden
  • Diepgaande expertise in computer-ondersteunde drug design (CADD)
  • Snel resultaat en duidelijke wetenschappelijke ondersteuning

Stuur me alsjeblieft een bericht met je target PDB ID en ligandstructuren voordat je bestelt!


Technologie:

Excel

•

Jupyter-notitieboek

•

MATLAB

Type analyse:

Kwantitatieve analyse

•

Kwalitatieve analyse

Expertise:

Statistieken

Programmeertaal:

Python

•

R

•

SPSS

Tools:

Stata

•

Google Colab

•

Microsoft Excel