Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik analyseer single cell rna seq transcriptomics en multiomics
Bio-informatica, wetenschappelijk schrijven en data-analyse
Ik ben een bioloog en promovendus met ervaring in moleculaire biologie, bio-informatica, data-analyse, biotechnologie R&D, wetenschappelijk schrijven en onderzoeksbegeleiding. Ik help onderzoekers, st...
Over deze dienst
Ik help onderzoekers, studenten en biotech-teams bij het analyseren van transcriptomics, single-cell RNA-seq en multi-omics data met duidelijke, reproduceerbare en biologisch betekenisvolle resultaten.
Ik kan werken met bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, genexpressiematrices, GEO datasets, verwerkte proteomics tabellen en andere biologische datasets die differential expression, clustering, marker genes, pathway enrichment of biomarker discovery vereisen.
Afhankelijk van je project kan ik QC-samenvattingen, PCA, UMAP, clustering, volcano plots, heatmaps, differential expression analyse, GO/KEGG enrichment, kandidaatgenen, biologische interpretatie, reproduceerbare R/Python code en een gestructureerd rapport leveren.
Mijn achtergrond als bioloog en PhD-kandidaat stelt me in staat om computationele resultaten te koppelen aan echte biologische context, niet alleen plots of tabellen te leveren.
Voor raw FASTQ-bestanden, grote single-cell datasets of complexe multi-omics projecten, neem eerst contact met me op voordat je bestelt, zodat ik het datatypes, experimenteel ontwerp en haalbaarheid kan beoordelen.
Domein:
Overige
Expertise:
Overige
Programmeertaal:
Python
•
R
Tools:
Overige
Technologie:
Python
•
R
•
Jupyter-notitieboek
•
RStudio
Modellen en methoden:
Overige
Andere Data science en ML diensten die ik aanbied
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welk type omics data kun je analyseren?
Ik kan werken met bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, genexpressiematrices, GEO datasets, verwerkte proteomics tabellen en andere biologische datasets, afhankelijk van het formaat en het doel.
Analyseer je raw FASTQ-bestanden?
Raw FASTQ analyse is alleen mogelijk na overleg, omdat het afhangt van de bestandsgrootte, aantal monsters, QC-behoeften en de benodigde pipeline. Neem eerst contact op.
Kun je werken met publieke datasets van GEO?
Ja. Ik kan helpen bij het analyseren van publieke datasets van GEO of soortgelijke repositories, mits de data beschikbaar, goed geannoteerd en geschikt voor de gevraagde analyse zijn.
Analyseer je single-cell RNA-seq data?
Ja. Ik werk met single-cell RNA-seq data met Seurat of Scanpy, inclusief QC, clustering, UMAP, marker genes en biologische interpretatie.
Kun je proteomics data analyseren?
Ja, als je verwerkte proteïne-abundantiematrices, LFQ-intensiteit tabellen of genormaliseerde proteomics resultaten aanlevert. Raw mass spectrometry bestanden zijn niet standaard inbegrepen.
Kun je significante genen of biomarkers garanderen?
Nee. Resultaten hangen af van de monsters, datakwaliteit, experimenteel ontwerp en biologische signalen. Ik bied rigoureuze analyse, maar kan geen specifieke bevindingen garanderen.
Wat heb je nodig om te beginnen?
Ik heb je dataset, metadata of monstersinformatie, groepslabels, onderzoeksvraag, verwachte outputs en eventuele voorkeurstools of formaten nodig.
Lever je code?
Ja. Afhankelijk van het pakket kan ik reproduceerbare R- of Python-code, scripts of een notebook met de analyseworkflow leveren.
Moet ik contact met u opnemen voordat ik bestel?
Ja. Bioinformatics projecten variëren sterk, dus het is beter om je datatypes, ontwerp en verwachte deliverables te bespreken voordat je begint.
