Ik voer RNA-seq differentiële expressie analyse uit in r met deseq2

Ik ben een computationeel bioloog met een MSc in Medical Biochemistry en onderzoekservaring bij A*STAR Singapore. Ik doe RNA-seq analyse voor onderzoekers die de data hebben en iemand nodig hebben om er betekenis aan te geven.

WAT JE KRIJGT

- Differentiale expressie met DESeq2, correct gespecificeerd voor jouw ontwerp

- Publicatieklare figuren op 300 dpi, in PNG en PDF

- Een resultaten tabel die je direct in een aanvullende file kunt plaatsen

- Het analyse script, geannoteerd, zodat jij of je lab het opnieuw kunnen uitvoeren

- Een geschreven interpretatie, inclusief wat de data NIET ondersteunt

WAAROM DAT LAATSTE PUNT BELANGRIJK IS

Reviewers vragen waarom je hebt gefilterd op een bepaalde drempel, of je hebt gecorrigeerd voor batch-effecten, en waarom een sample is uitgesloten. Alles wat ik lever is gedocumenteerd zodat jij die vragen kunt beantwoorden.

BEKIJK DE STANDAARD VOORDAT JE KOOPT

Een volledige uitgewerkte analyse van mij, code en figuren en kanttekeningen, is openbaar:

github.com/kND-17/hgsoc-origin-rnaseq

WAT IK VAN JOU NODIG HEB

Jouw counts matrix (of FASTQ-bestanden), een sample metadata sheet, en één zin over wat je wilt ontdekken. Stuur me een bericht voordat je bestelt als je niet zeker bent welke package geschikt is, en ik vertel je eerlijk wat het beste past.