Ik voer moleculaire docking en virtuele screening uit voor drug design

Sommige informatie is automatisch vertaald.

Pakistan

Ik spreek Engels

Bioinformatica-analist en RNA Seq data visualisatie

Ik help onderzoekers om biologische data om te zetten in duidelijke, reproduceerbare resultaten. Mijn focus ligt op bulk RNA-seq analyse met R en DESeq2, inclusief differentiële expressie, PCA, volcan...
Over deze dienst

Ontdek protein-ligand interacties met een duidelijk afgebakende workflow voor moleculaire docking en virtual screening.


Ik bereid jouw aangeleverde eiwitstructuur en ligandset voor, voer docking uit op een afgesproken bindingsplaats en organiseer de resultaten in bruikbare bestanden en duidelijke figuren.


Afhankelijk van je pakket, omvatten de opleveringen:

- Gerangschikte docking scores en binding poses

- 2D/3D interactiefiguren

- Vergelijkende analyse van geselecteerde liganden

- ADME-voorspellingen voor de top 5 verbindingen in Premium

- Methoden, belangrijke instellingen en een schriftelijke samenvatting van de resultaten


Alle pakketten dekken één eiwitdoelwit. Basic bevat tot 5 liganden, Standard 20 en Premium 50. Stuur vooraf de PDB-structuur of ID, ligandstructuren/IDs, details van de bindingsplaats en je onderzoeksdoel voordat je bestelt.


Docking scores en ADME-resultaten zijn computationele voorspellingen, geen bewijs van biologische activiteit. Moleculaire dynamica, QSAR, eiwitmodellering en extra doelen vereisen een aparte beoordeling. Revisies dekken de afgesproken scope; nieuwe verbindingen of doelen kosten extra.


Neem eerst contact met me op zodat we de inputkwaliteit, scope en levering kunnen bevestigen.

Mijn portfolio