Ik voer scrnaseq data-analyse uit

Sommige informatie is automatisch vertaald.

Cyprus

Ik spreek Grieks, Engels, Frans

Postdoctoraal onderzoeker in Bioinformatica

Ik ben een postdoctoraal onderzoeker in bioinformatica bij biobank.cy, Universiteit van Cyprus, met expertise in omics data-analyse, ontwikkeling van innovatieve webgebaseerde toepassingen en machine ...
Over deze dienst

Ik voer hoogwaardige single-cell RNA-seq (scRNA-seq) data-analyse uit met behulp van R-pakketten zoals Seurat, SingleR, SingleCellSignalR en AUCell om je te helpen betekenisvolle inzichten uit je dataset te halen.


Of je nu student, onderzoeker of onderdeel van een biotech-lab bent, ik bied een betrouwbare, reproduceerbare en publicatieklare analyseworkflow samen met resultaatinterpretatie.


Mijn analyse omvat:

  • Kwaliteitscontrole (QC) en filtering van cellen en genen
  • Data-normalisatie, schaling en integratie (indien nodig)
  • Dimensionaliteitsreductie (PCA, UMAP/t-SNE)
  • Cellenclustering en identificatie van marker genen
  • Differentiële expressieanalyse tussen clusters of condities
  • Functionele verrijking (GO/KEGG) van marker genen
  • Publicatieklare plots (UMAP/t-SNE, heatmaps, feature plots)
  • Duidelijk samenvattingsrapport en reproduceerbare Seurat-scripts.


Ik kan werken met ruwe count-matrices of verwerkte data.

Als je specifieke eisen hebt, experimentele condities of een voorkeursreferentiegenoom, neem dan contact met mij op voordat je bestelt.

De deliverables worden afgestemd op de grootte van je dataset en je onderzoeksdoelen, zodat je scRNA-seq resultaten klaar zijn voor presentaties, scripties of publicatie.

Gerelateerde tags