Ik analyseer bulk- en single cell rna seq data


Over deze dienst
Automatische vertaling
Ben je op zoek naar een bioinformatica-expert die echt de medische en biologische betekenis achter de code begrijpt?
Ik ben een klinisch arts en oncologieonderzoeker die gespecialiseerd is in transcriptomics. Ik overbrug de kloof tussen ruwe data en publicatieklare biologische inzichten, zodat jouw resultaten niet alleen statistisch significant zijn, maar ook biologisch betekenisvol.
Mijn diensten omvatten:
- Bulk RNA-seq analyse: Kwaliteitscontrole, Differential Expression Analysis (DESeq2/edgeR), Pathway Enrichment (GO/KEGG/GSEA) en overlevinganalyse.
- Single-Cell RNA-seq (scRNA-seq): Celclustering en dimensionaliteitsreductie (UMAP/t-SNE), celtype-annotatie, trajectinference en communicatie tussen cellen.
- Data visualisatie & graphics: Hoogwaardige, publicatieklare figuren (Heatmaps, Volcano plots, Violin plots, multi-panel layouts) en op maat gemaakte wetenschappelijke posterontwerpen.
Waarom voor mij kiezen?
- Dubbele achtergrond: Ik interpreteer data vanuit een klinisch perspectief, waardoor je tijd bespaart met het uitleggen van basisbiologie.
- Vaardig in R & Python: Op maat gemaakte, reproduceerbare scripts met Jupyter of RStudio.
Neem ALTIJD CONTACT OP VOORDAT je bestelt om de details van je project en dataformaat te bespreken!
Maak kennis met Dongyao Zhang
As a clinical MD and active oncology researcher, my dual background bridges th
- Afkomstig uitChina
- Lid sindsapr 2026
- Gem. reactietijd1 uur
Talen
Chinees, Engels
Automatische vertaling
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welk type dataformaat heb je nodig om de analyse te starten?
Ik begin meestal met count matrices (.csv/.txt), h5-bestanden of Seurat/Scanpy-objecten. Als je alleen ruwe FASTQ-bestanden hebt, stuur me dan eerst een bericht, omdat ruwe sequentie-uitlijning een aangepaste offerte vereist.
Bied je de broncode (R- of Python-scripts) aan samen met de resultaten?
Absoluut! Reproduceerbaarheid in onderzoek is voor mij belangrijk. Ik lever schone, goed commentaar gevende R-scripts of Python Jupyter Notebooks samen met je eindresultaten in hoge resolutie en data tabellen.
Kun je helpen de biologische betekenis achter de analyse-resultaten te interpreteren?
Ja! Als klinisch arts en oncologieonderzoeker run ik niet alleen statistische modellen. Ik help bij het interpreteren van pathway-enrichments, cell-cell interacties en hun klinische relevantie voor jouw studie.
Zijn de data visualisaties klaar voor publicatie in een tijdschrift?
Ja. Ik lever figuren in hoge resolutie (PDF/TIFF) zoals UMAPs en heatmaps. Met mijn ervaring in wetenschappelijke poster- en grafisch ontwerp kan ik ook kleuren en multi-panel layouts aanpassen voor jouw doel-tijdschrift.

