Ik geef live zoom training over moleculaire dynamica simulatie

Wil je leren over Molecular Dynamics (MD) simulatie via duidelijke, praktische en live Zoom-trainingen?

Ik bied stapsgewijze begeleiding op maat voor beginners, studenten en onderzoekers die de MD-workflows met GROMACS willen beheersen.

Pakketten

Basis: Proteïne MD-simulatie

Leer de volledige workflow voor het simuleren van een eiwit in water.

Volledige GROMACS-workflow

Systeemopzet: Eiwit in water, boxafmetingen tot 10 × 10 × 10 nm

Essentiële analysetools:

RMSD, RMSF, Radius of Gyration (Rg), Waterstofbruggen

Standaard: Proteïne-Ligand MD-simulatie

Inclusief alles in Basis, plus:

Voorbereiden en simuleren van een eiwit-ligand complex in water

Workflow voor ligand topologie generatie

Extra analyse relevant voor bindingsstudies

Premium: Geavanceerde MD-simulatie

Inclusief alles in Standaard, plus:

Membraan eiwit MD-simulatie (membraan bouwen + insertie)

Extra analysemogelijkheden, zoals:

Afstand, SASA, Clustering, MSD, Contacts, aangepaste plots, enz.

Geschikt voor complexe, publicatieklare projecten

Belangrijke informatie

Deel je protein PDB-bestand of PDB-ID vóór de sessie.

Op maat gemaakte prijzen gelden voor zeer grote of multimerische eiwitten of complexe analyses.