Ik voer bioinformatics data analyse uit met python en r

Sommige informatie is automatisch vertaald.
Emil V

Rusland

Ik spreek Russisch, Engels

Bioinformaticus, Python ontwikkelaar

Ik ben een bioinformaticus en Python ontwikkelaar met drie jaar ervaring in het ontwerpen van applicaties en pipelines voor het verwerken en visualiseren van bioinformatics data. Ik ben bedreven in Fl...
Lees meer
Over deze dienst

Ik ben een bioinformaticus en Python/R ontwikkelaar met meer dan 5 jaar ervaring in het verwerken van NGS datasets en het ontwikkelen van analytische workflows. Mede-auteur van 15 peer-reviewed publicaties (Genome Medicine, Epigenetics & Chromatin).


Diensten:

  • NGS Data Analyse: WGS/WES (GATK, SNP-prioritering, variant calling), RNA-seq (DESeq2), ChIP-seq (ChIPseeker), en Hi-C/Exo-C (Juicer, Juicebox).
  • Bioinformatics Scripting: Op maat gemaakte scripts en pipeline-ontwikkeling in Python (Pandas, NumPy, scikit-learn) en R (Bioconductor).
  • Tools & Omgevingen: BLAST, BWA, Bowtie2, SAMtools, Picard, Docker, Conda, Bash.
  • Data Visualisatie: Publicatieklare figuren met Matplotlib, Seaborn, Plotly en ggplot2.

Leveringen:

  • Verwerkte sequentiegegevens en variantbestanden (VCF, BAM, BED, tellingmatrices).
  • Net, gedocumenteerd code en reproduceerbare omgevingsinstellingen.
  • Samenvattingsrapporten met figuren en data-interpretaties.


Neem contact met mij op voordat je een bestelling plaatst om je datastructuur en projectvereisten te bespreken.

Lees meer
do bioinformatics data analysis using python and r
Volledig scherm
do bioinformatics data analysis using python and r

Technologie:

Python

•

RStudio

Expertise:

Classificatie

•

clustering

•

Data-extractie

+5 meer

Gerelateerde tags