Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik voer MD-simulaties uit van gemodificeerde eiwitten en ligandcomplexen
Associate Professor in Fysische Chemie
Ik ben Ephriem Mengesha, een PhD in Fysische Chemie en Associate Professor met meer dan 15 jaar onderzoek- en onderwijservaring. Ik bied freelance diensten aan in computational chemistry, moleculaire ...
Over deze dienst
Ik bied professionele moleculaire dynamica (MD) simulaties met behulp van Schrödinger Maestro (Desmond) voor eiwitten, eiwitligandcomplexen en covalent gemodificeerde eiwitten. Mijn diensten omvatten systeemvoorbereiding, opzet van de simulatie, productie MD-runs en uitgebreide trajectanalyse (RMSD, RMSF, Radius of Gyration, SASA, waterstofbruggen, secundaire structuur en meer). Je ontvangt figuren van publicatiewaardige kwaliteit, simulatiebestanden en een duidelijk wetenschappelijk rapport ter ondersteuning van je onderzoek of productontwikkeling.
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke informatie heb je nodig om het project te starten?
Meestal heb ik de eiwitstructuur nodig (PDB-bestand of PDB-ID), ligandstructuur (indien van toepassing), details van covalente modificaties of mutaties, je onderzoeksdoelen en de gewenste simulatieperiode. Als je het niet zeker weet, kan ik helpen de beste opzet te bepalen.
Kun je chemisch gemodificeerde eiwitten of covalente eiwit–ligandcomplexen simuleren?
Ja. Ik kan covalent gemodificeerde eiwitten modelleren.
Wat ontvang ik aan het einde van het project?
Je ontvangt de invoer- en uitvoerbestanden van de simulatie, trajectbestanden, analyses van publicatiewaardige kwaliteit (zoals RMSD, RMSF, Rg, SASA en secundaire structuur) en een beknopt rapport dat de resultaten uitlegt en de structurele stabiliteit van je systemen vergelijkt.
