Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik analyseer RNA-seq data met deseq2, edger, go, kegg en pca
Complexe wetenschap vertalen naar duidelijke, impactvolle content
Biotechnoloog en Data Scientist met meer dan 2 jaar ervaring in Amerikaanse instellingen, gespecialiseerd in Bioinformatics, Genomics en wetenschappelijk schrijven. Ik breng de kloof tussen complexe b...
Over deze dienst
Ben je op zoek naar een grondige, publicatieklare RNA-seq analyse, niet een script dat alleen een CSV uitspuugt?
Ik ben Dr. Faisal, een plantmoleculair bioloog met een PhD en postdoctoraal onderzoeker (Connecticut Agricultural Experiment Station, VS) met meer dan 35 peer-reviewed publicaties en praktische RNA-seq ervaring bij meer dan 20 soorten.
WAT JE KRIJGT:
QC (FastQC/MultiQC)
Trimming en alignment (HISAT2/STAR of kallisto/salmon)
Differentiële expressie (DESeq2/edgeR)
PCA, volcano plots, heatmaps
GO verrijking en KEGG padanalyse
Geschreven biologische interpretatie
VOOR WIE DIT IS:
HBO-studenten, postdocs en labs met ruwe FASTQ- of count-data die een correcte, publicatieklare analyse nodig hebben, niet alleen cijfers.
WAT IK VAN JOU NODIG HEB:
FASTQ-bestanden, count matrix of SRA-toegangscodes
Experimenteel ontwerp (welke monsters bij welke groep horen)
Referentiegenoom / soort
Stuur me een bericht voordat je bestelt als je dataset groot is of van een niet-model soort, zodat ik een juiste offerte kan maken.
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke invoergegevens heb je van mij nodig?
Ik heb je ruwe RNA-seq data (FASTQ-bestanden) of count matrix nodig. Ook je sample metadata (condities, replicaten, etc.). Als je referentiegenoominformatie hebt, deel dat dan ook.
Welke bioinformatica tools gebruik je?
Ik gebruik standaard tools zoals DESeq2, edgeR, limma-voom, ggplot2, pheatmap, clusterProfiler en anderen voor GO en KEGG verrijking. Alle code is reproduceerbaar en wordt aan jou geleverd.
Lever je de R code/script aan?
Ja! Voor de Standard en Premium pakketten lever ik de volledige R script die voor de analyse is gebruikt. Zo is je analyse volledig reproduceerbaar.
Kun je datasets groter dan 24 samples aan?
Ja! Als je meer dan 24 samples hebt, neem dan contact met me op voordat je bestelt. Ik kan een aangepaste offerte maken op basis van je datasetgrootte.
