Ik voer rnaseq ngs analyse uit van ruwe reads tot differentiële expressie

Sommige informatie is automatisch vertaald.
Farah Saleem

Pakistan

Ik spreek Urdu, Engels

2 bestellingen voltooid

Waar onderzoekskennis samenkomt met uitmuntend academisch schrijven

Ik ben een bioinformaticus, onderzoeker en academisch schrijver met uitgebreide expertise in Python, C, C++ en front-end ontwikkeling (HTML, CSS, JavaScript, Bootstrap). Mijn sterke achtergrond in dat...
Lees meer
Over deze dienst

Ik bied end-to-end RNA-seq en NGS-analyse, van ruwe sequencing reads tot differentiële expressie resultaten en publicatieklare visualisaties.

Wat ik lever:

  • Quality control & read trimming (FastQC, fastp)
  • Aligneren/quantificeren (Salmon)
  • Differentiële expressie analyse (DESeq2 in R)
  • Visualisaties: volcano plots, PCA plots, heatmaps
  • Pad- en verrijkingsanalyse (GO/KEGG) Premium pakket
  • ML-gebaseerde voorspellende modellering op expressie data Premium pakket

Tools: Python, R, Salmon, DESeq2, tximport, ggplot2

Of je nu de volledige pipeline nodig hebt of alleen hulp bij één fase, bijvoorbeeld, je hebt al een counts matrix en hebt alleen differentiële expressie en plots nodig, ik kan beginnen waar je data zich momenteel bevindt.

Lees meer
do rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expression
Volledig scherm
do rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expression
Volledig scherm
Volledig scherm
do rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expressiondo rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expressiondo rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expression

Gerelateerde tags