Ik analyseer single cell rna seq data met r en seurat

Werk je met single-cell RNA sequencing data en heb je hulp nodig met je Seurat workflow?

Ik bied duidelijke en reproduceerbare single-cell RNA-seq analyse met R en Seurat. Afhankelijk van het gekozen pakket kan ik helpen met:

Kwaliteitscontrole en cell filtering

Normalisatie en variabele feature selectie

PCA, UMAP, clustering en batch-effect beoordeling

Marker gen en differentiële expressie analyse

Basis cell-type annotatie met bekende markers

Publicatieklare UMAP, violin, feature, dot en heatmap plots

Problemen oplossen met Seurat objecten, assays, lagen en analysefouten

Je ontvangt georganiseerde R code, analyse-uitkomsten, figuren en een duidelijke uitleg van de workflow. Ik focus op nauwkeurige analyse, transparante communicatie en resultaten die jij kunt begrijpen en reproduceren.

Let op: je moet een count matrix, verwerkte expressiematrix of Seurat object aanleveren. Raw FASTQ verwerking is niet inbegrepen. Cell annotatie is gebaseerd op beschikbare markers en referentie-informatie en moet biologisch gevalideerd worden.

Neem contact met mij op voordat je bestelt om je datagrootte, onderzoeksvraag, verwachte opleveringen en planning te bespreken.