Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik analyseer je single cell rna seq data en geef op maat gemaakte inzichten
De codeert de toekomst van biologie
Genyx LLC is een biotech-, bio-informatica- en AI-gedreven softwarebedrijf dat oplossingen van de volgende generatie ontwikkelt voor genomica, gezondheidszorg en life sciences. We specialiseren ons in...
Over deze dienst
Ik bied maatwerk single-cell RNA-seq analyse die is afgestemd op jouw dataset en onderzoeksdoelen. Elk project wordt aangepast aan de biologische vraag, met toepassen van reproduceerbare workflows in R of Python (Seurat, Scanpy, etc.) om resultaten van hoge kwaliteit en interpreteerbaar te leveren.
De diensten omvatten:
- Kwaliteitscontrole en filtering
- Normalisatie, schaalverdeling en dimensionaliteitsreductie (PCA, UMAP/t-SNE)
- Clustering en identificatie van marker genes
- Optioneel celtype-annotatie en pathway-enrichmentsanalyse
- Genereren van publicatieklare visualisaties en samenvattende rapporten
Met meer dan vier jaar ervaring in bioinformatica en meerdere omics-disciplines, zorg ik dat elke analyse robuust, transparant en biologisch betekenisvol is. Neem vooraf contact op voordat je bestelt om je data en analyse doelen te bespreken.
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke soorten data kan ik aanleveren?
Je kunt zowel ruwe FASTQ-bestanden (voor verwerking met Cell Ranger of vergelijkbaar) als verwerkte count matrices (bijvoorbeeld .mtx, .h5 of .csv formaat) aanleveren. Ik pas de workflow aan op basis van het datatypes en je projectdoelen.
Voer je ook ruwe data verwerking uit (FASTQ naar count matrix)?
Ja. Deze stap kan als extra service worden toegevoegd en omvat read alignment, UMI-telling en het genereren van de expressiematrix die geschikt is voor verdere analyse.
Welke hulpmiddelen gebruikt u voor de analyse?
Ik gebruik vooral Seurat, Scanpy, Monocle3 en Cell Ranger, samen met standaard R- en Python-pakketten voor visualisatie en enrichmentsanalyse.
Kun je meerdere samples of batches integreren?
Ja. Batch correction en multi-sample integratie kunnen als extra worden toegevoegd. Ik gebruik Seurat v4, Harmony of Scanorama, afhankelijk van de datasetkenmerken
Hoe bespreken we de biologische vraag of analyseplan?
Vooraf wisselen we een paar berichten uit om je hoofdobjectieven en datadetails te bepalen. Daarna bevestig ik het beste pakket of stel ik een op maat gemaakt aanbod voor indien nodig.
