Ik zal uw fastq-monsters downloaden en afstemmen op het genoom

Publieke microarray- of RNAseq-gegevens zijn erg handig voor verschillende analyses. Deze bestanden zijn erg groot, en er is een krachtige computernet infrastructuur voor nodig om ze te verkrijgen. Met behulp van een linux HPC download ik al je data (fastq samples) uit openbare databases zoals SRA, ENA, NIH, enzovoort. Ik alignereer ze op het genoom (mens, muis, zebravis...) met STAR of Salmon aligner, en ik geef je de ruwe tellingen waarmee je downstream analyses kunt uitvoeren.

Bovendien lever ik een html-rapport met de metrics, statistieken en kwaliteitscontrole stappen van de uitgelijnde samples.

Elke sample kost 5 dollar

Als je vragen hebt, schrijf me en we praten!