Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik voer moleculair docking uit en eiwit-ligand interactie analyse
Over deze dienst
<pBen je op zoek naar nauwkeurige moleculaire docking en computationele drug discovery diensten voor jouw onderzoek of publicatie? Ik bied professionele structurele virtuele screening, binding affinity berekeningen en 2D/3D interactieprofilering.
Diensten die ik aanbied in deze dienst:
- Target voorbereiding: PDB opschoning, water/heteroatom verwijdering en protonatie status toewijzing.
- Ligand voorbereiding: Structuuroptimalisatie, genereren van 3D conformers en energie-minimalisatie.
- Moleculaire docking: Grid-box optimalisatie en binding pose berekening met AutoDock Vina.
- Interactie-analyse: Hoogresolutie 2D (LigPlot+) en 3D (PyMOL) interactiekarting die H-bonds en hydrofobe contacten toont.
- Drug-likeness: ADME-Tox en Lipinski's Rule of 5 evaluatie met SwissADME.
Waarom kiezen voor mijn dienst?
- Sterke basis in Bioinformatics & Computational Biology
- Publicatieklare, hoge resolutie figuren (300+ DPI)
- Complete ruwe data geleverd (.pdbqt, logs, output poses)
- Snelle doorlooptijd en responsieve communicatie
Stuur me een bericht met je target PDB ID en ligandstructuren (SMILES/SDF/PDB) om je project te bespreken voordat je bestelt.
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke bestanden of data moet ik aanleveren om te beginnen?
Je hoeft alleen de PDB ID (of structuurbestand) van het target eiwit en je ligandstructuren (SMILES, PubChem CID, SDF of PDB formaat) aan te leveren.
Welke docking- en visualisatietools gebruik je?
Ik gebruik voornamelijk AutoDock Vina voor moleculaire docking, PyMOL en Discovery Studio voor 3D interactiediagrammen, en LigPlot+ / SwissADME voor 2D-kaarten en drug-likeness.
Lever je de ruwe output en configuratiebestanden aan?
Ja, elk pakket bevat alle ruwe outputbestanden (.pdbqt, dock logs, binding affinities en output poses).
Kun je aangepaste batch screening voor meerdere verbindingen uitvoeren?
Ja. Als je een aangepaste verbindingenbibliotheek hebt (10 tot 500+ moleculen), stuur me dan direct een bericht en ik stuur een op maat gemaakte aanbieding.
