Ik lever dockings- en MD-simulatie diensten


Level 2
Over deze dienst
Automatische vertaling
DockVision is meer dan een gewone freelance dienst. De meeste verkopers kunnen bioinformatica diensten aanbieden. Het echte verschil zit in weten welke methode je moet gebruiken, hoe je de workflow correct ontwerpt en hoe je ruwe computationele output omzet in wetenschappelijk betekenisvolle resultaten. Daar onderscheidt mijn expertise zich in.
Ik ben een computationeel wetenschapper met meer dan 5 jaar praktische ervaring en 100+ voltooide projecten voor klanten uit 30+ landen. Ik beheer complexe onderzoeksworkflows die verder gaan dan simpelweg software draaien en basisoutput leveren.
Mijn expertise omvat:
- Protein-Ligand Docking
- Protein-Protein Docking
- Protein-DNA/RNA Docking
- Metaalion Docking
- Nano-deeltjes Docking
- Peptide Docking
- Membraan simulaties
- Nucleïnezuur simulaties
- Peptide/Polymeer simulaties
- Verbeterde sampling MD simulaties
Post-simulatie analyse:
- MM/PBSA & MM/GBSA
- PCA/DCCM/ FEL
- SASA & Rg
- H-bron analyse
- Clustering analyse
- ProteinLigand interactie analyse
- Secundaire structuur analyse
- Contactkaart analyse
- Afstand & hoek analyse
- Residue interactie
Mijn doel is het leveren van wetenschappelijk degelijke, reproduceerbare analyse met duidelijke interpretatie, publicatieklare visualisaties en goed georganiseerde resultaten.
Maak kennis met DockVision
Computational Biologist and Data Scientist
Level 2
- Afkomstig uitPakistan
- Lid sindsaug 2022
- Gem. reactietijd1 uur
- Laatste levering1 dag
Talen
Engels, Spaans, Duits, Frans, Italiaans
Automatische vertaling
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Ben jij een expert bioinformaticus?
Ja, ik heb meer dan 5 jaar professionele ervaring in bioinformatica, met succes gewerkt aan moleculaire docking, moleculaire dynamica simulaties en geavanceerde computationele onderzoeksprojecten voor internationale klanten.
Kun je drug targets voorspellen?
Ja, ik werk met sequentiegegevens. Afhankelijk van de behoeften van de klant, kan ik kandidaten voor drug targets voorspellen, en virtuele drug screening is ook een optie.
Is de prijs hetzelfde voor alle taken in GIG?
Nee, dat is niet hetzelfde voor alle projecten. Het hangt af van het project en hoe uitgebreid het is.
Welke informatie heb je nodig om het project te starten?
Ik heb de eiwitstructuur (PDB ID of bestand), ligand/peptide structuur en duidelijke projectdoelstellingen nodig.
Welke software gebruik je?
Ik werk met AutoDock Vina, Schrödinger, MOE, HADDOCK, GROMACS, NAMD, ACEMD, Desmond, VMD, PyMOL, ChimeraX, CHARMM-GUI, AmberTools, PLUMED, Python, R, Bash/Linux, Claude Code, Cursor, Jupyter, en Python libraries zoals MDAnalysis, MDTraj, ProDy, Biopython, NumPy, Pandas, Matplotlib en SciPy.
Hoe lang duren de MD-simulaties die je uitvoert?
Meestal 50–500 ns, afhankelijk van de projectvereisten. Langere simulaties kunnen worden geregeld indien nodig.
Kun je helpen met de interpretatie van de resultaten?
Ja, ik bied duidelijke wetenschappelijke interpretatie om je te helpen begrijpen of je complex stabiel en veelbelovend is.
Is jouw werk geschikt voor publicatie?
Ja, de analyse en rapporten worden opgesteld volgens academische en onderzoeksstandaarden.
Welke analyses worden uitgevoerd na MD-simulatie?
RMSD, RMSF, Radius of Gyration, Waterstofbrug analyse, SASA, interactiestabiliteit, en binding free energy (MM-PBSA/MM-GBSA), PCA, DCCM, FEL, Cluster Analyse, en nog veel meer.
Kun je virtueel screening uitvoeren van grote compound libraries?
Ja, ik kan meerdere verbindingen screenen en rangschikken op basis van binding affinity en interactiekwaliteit.
54 reviews van deze dienst
| (48) | ||
| (5) | ||
| (1) | ||
| (0) | ||
| (0) |
Specificering van de beoordeling
- Communicatieniveau van de freelancer
- Kwaliteit van de levering
- Waarde van de levering
Sorteer op
M maalotaibi

Saoedi-Arabië
Lopende samenwerkingThe order was delivered before the agreed time and the quality of work was good, I will do other service with him again
US$ 200-US$ 400
Prijs
4 dagen
Looptijd
Nuttig?J joy_hj

Verenigde Staten
Lopende samenwerkingnice work N
US$ 200-US$ 400
Prijs
5 dagen
Looptijd
Nuttig?J joy_hj

Verenigde Staten
Lopende samenwerkinggrt work and fast
US$ 50-US$ 100
Prijs
2 dagen
Looptijd
Nuttig?A aashamrani

Saoedi-Arabië
Lopende samenwerkingoutstanding effort and truly excellent work.
US$ 400-US$ 600
Prijs
9 dagen
Looptijd
Nuttig?J just_som_motion

Italië
Lopende samenwerkingOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
US$ 50-US$ 100
Prijs
2 dagen
Looptijd
H 
Reactie van de freelancer
Nuttig?
54 reviews van deze dienst
| (48) | ||
| (5) | ||
| (1) | ||
| (0) | ||
| (0) |
Specificering van de beoordeling
- Communicatieniveau van de freelancer
- Kwaliteit van de levering
- Waarde van de levering
Sorteer op
M maalotaibi

Saoedi-Arabië
Lopende samenwerkingThe order was delivered before the agreed time and the quality of work was good, I will do other service with him again
US$ 200-US$ 400
Prijs
4 dagen
Looptijd
Nuttig?J joy_hj

Verenigde Staten
Lopende samenwerkingnice work N
US$ 200-US$ 400
Prijs
5 dagen
Looptijd
Nuttig?J joy_hj

Verenigde Staten
Lopende samenwerkinggrt work and fast
US$ 50-US$ 100
Prijs
2 dagen
Looptijd
Nuttig?A aashamrani

Saoedi-Arabië
Lopende samenwerkingoutstanding effort and truly excellent work.
US$ 400-US$ 600
Prijs
9 dagen
Looptijd
Nuttig?J just_som_motion

Italië
Lopende samenwerkingOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
US$ 50-US$ 100
Prijs
2 dagen
Looptijd
H 
Reactie van de freelancer
Nuttig?

