Ik analyseer single cell rna seq en spatial transcriptomics data

Sommige informatie is automatisch vertaald.
5,0
5,0

Duitsland

Ik spreek Duits, Engels

10 bestellingen voltooid

Eenvoudige oplossingen voor complexe biomedical data

Hoi, ik ben Jonathan Alles. Ik ben een onafhankelijke bioinformatics en data engineering consultant. Via mijn bureau, EVOBYTE Digital Biology, ondersteun ik professionals met biomedical data engineeri...
Over deze dienst

Heb je ondersteuning nodig bij het analyseren, integreren of interpreteren van single cell omics data?

Ik ondersteun onderzoeksteams bij data-analyse voor scRNA-Seq, single cell immune receptor of spatial omics analyse.


Op maat gemaakte analyses zijn mogelijk: Neem contact op voor een offerte.


Wat ik aanbied:

Bioinformatica Analyse

  • Bioinformatische verwerking van sequencing raw data
  • Aggregatie, filtering, opschoning, batchcorrectie
  • Metadata-invoer
  • Clustering en clusterannotatie
  • Differentiële genexpressie
  • Trajectinferenz
  • GSEA / GO Term Analyse
  • Spatial neighborhood analyse

Visualisatie & rapportage

  • Jupyter notebook inclusief analysecode
  • Op maat gemaakte PDF- of HTML-rapporten
  • Dashboards voor dataquery

Pipeline ontwikkeling & automatisering

  • Automatisering en schaalvergroting van analysepijplijnen
  • Database- en cloudintegratie
  • Containerisatie

Data curatie

  • Verzamel (single-cell) omics data voor een specifieke indicatie, therapeutische modaliteit, soort,...
  • Mijn openbare databronnen en databases doorzoeken en een geïntegreerde dataset teruggeven


Tech stack

Python / Pandas / scVerse / scipy / Jupyter / TF / Bash / Cell Rank / squidpy / scVelo


Laten we samen bouwen!

Heb je een project in gedachten? Stuur me een bericht om je wensen te bespreken, en ik bied een op maat gemaakte oplossing aan.

Programmeertaal:

Python

Technologie:

Jupyter-notitieboek

Type analyse:

Kwantitatieve analyse

Kwalitatieve analyse

Expertise:

Experimentontwerp

Trends

Algoritmes

Clusteranalyse

Tools:

Overige

Mijn portfolio

Reviews

2 reviews van deze dienst
5,0

(2)
(0)
(0)
(0)
(0)
Specificering van de beoordeling
  • Communicatieniveau van de freelancer
    5
  • Kwaliteit van de levering
    5
  • Waarde van de levering
    5
Sorteer op
Meest relevant
  • J

    j_chem23

    CA

    Canada

    5

    Extremely knowledgeable researcher with a high quality of work and professionalism. Reliable data analysis with easy to observe and digest results. Highly recommend.

    US$ 400-US$ 600

    Prijs

    8 dagen

    Looptijd

    Nuttig?
    Ja
    Geen
  • M

    matteobertelli

    IT

    Italië

    5

    Jonathan Alles is an outstanding professional in the field of Data Analytics. His meticulous attention to detail, unwavering professionalism, and exemplary responsiveness greatly contributed to a smooth and efficient collaboration. The quality of his work is exceptional, and I would unreservedly recommend...

    US$ 600-US$ 800

    Prijs

    3 weken geleden

    Looptijd

    Nuttig?
    Ja
    Geen
Reviews

2 reviews van deze dienst
5,0

(2)
(0)
(0)
(0)
(0)
Specificering van de beoordeling
  • Communicatieniveau van de freelancer
    5
  • Kwaliteit van de levering
    5
  • Waarde van de levering
    5
Sorteer op
Meest relevant
  • J

    j_chem23

    CA

    Canada

    5

    Extremely knowledgeable researcher with a high quality of work and professionalism. Reliable data analysis with easy to observe and digest results. Highly recommend.

    US$ 400-US$ 600

    Prijs

    8 dagen

    Looptijd

    Nuttig?
    Ja
    Geen
  • M

    matteobertelli

    IT

    Italië

    5

    Jonathan Alles is an outstanding professional in the field of Data Analytics. His meticulous attention to detail, unwavering professionalism, and exemplary responsiveness greatly contributed to a smooth and efficient collaboration. The quality of his work is exceptional, and I would unreservedly recommend...

    US$ 600-US$ 800

    Prijs

    3 weken geleden

    Looptijd

    Nuttig?
    Ja
    Geen

Gerelateerde tags