Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik voer bulk en single cell rna seq bioinformatica analyse uit
Juliia N
Over deze dienst
Automatische vertaling
Ik ben een bioinformaticus die RNA-seq analyse aanbiedt met behulp van industry-standard tools DESeq2, Scanpy en Cytoscape, niet geautomatiseerde black-box pipelines. Elke script wordt handmatig uitgevoerd en gecontroleerd voordat ik het lever, zodat de resultaten nauwkeurig zijn en klaar voor jouw thesis, dissertatie of manuscript.
BASIS Bulk RNA-Seq Differential Expression
DESeq2 analyse van jouw ruwe counts-tabel. Je krijgt een volcano plot, heatmap van de meest significante genen, een Excel-tabel met Log2FC en aangepaste p-waarden, en een korte Methods-paragraaf. Klaar voor publicatie, 300dpi.
STANDAARD + Protein-Protein Interaction Network
Alles in Basic, plus een STRING-gebaseerd eiwit-interactienetwerk gebouwd in Cytoscape, met identificatie van hub-genen (cytoHubba) en een tabel met jouw top 10 hub-genen.
PREMIUM Single-Cell RNA-seq Analyse
Volledige single-cell pipeline in Scanpy: kwaliteitscontrole, clustering en UMAP-visualisatie. Celtypes worden gelabeld op basis van echte marker gen output, nooit geraden. Inclusief UMAP-plot, violin plots voor marker genen, en een marker gen tabel per cluster.
Ik bevestig altijd dat de sample namen overeenkomen tussen jouw bestanden voordat ik begin, dit voorkomt fouten in jouw resultaten.
Maak kennis met Juliia N
Juliia N
Bioinformatics Specialist for Genomics, Microbiome and Drug Discovery
- Afkomstig uitPolen
- Lid sindsaug 2026
- Gem. reactietijd1 uur
Talen
Pools, Oekraïens, Russisch, Engels
Bioinformatics specialist with an MSc and a strong academic focus on microbiology and biochemistry. I work with differential gene expression (DESeq2), single-cell analysis (Scanpy), microbiome profiling (phyloseq/vegan), molecular docking (AutoDock Vina), clinical variant annotation (Ensembl VEP), and publication-ready visualization — all built and tested in RStudio/Python with full reproducibility. Co-Founder & CSO of Forneus Technologies, leading biological data strategy for our bioinformatics and AI-driven HealthTech tools.
Automatische vertaling
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welk bestandsformaat heb je nodig voor de ruwe data?
CSV of TSV met ruwe read counts (genen als rijen, monsters als kolommen), plus een apart metadata-bestand dat sample namen koppelt aan groepen.
Voer je sequencing alignment uit (FASTQ naar counts)?
Nee, deze dienst begint vanaf een ruwe counts-matrix. Als je alleen FASTQ-bestanden hebt, stuur me dan een bericht voordat je bestelt voor een aangepaste offerte.
Kun je helpen de biologische betekenis van de resultaten te interpreteren?
Ja. Ik geef een feitelijke samenvatting op basis van jouw daadwerkelijke cijfers, en voor Premium identificeer ik hub-genen en celtypes direct uit jouw data.
Welke software gebruik je?
R (DESeq2, ggplot2, pheatmap), Python (Scanpy) voor single-cell, en Cytoscape voor netwerkanalyse — allemaal standaard, peer-reviewed tools.
