Ik voer rnaseq, atacseq of scrnaseq analyse uit met volledige bioinformatica

Ben je op zoek naar schone, inzichtelijke en reproduceerbare analyse van je sequencing data?

Ik ben gespecialiseerd in high-throughput data-analyse, waaronder RNA-seq, ATAC-seq en single-cell RNA-seq (scRNA-seq). Of je nu werkt met bulkmonsters of complexe single-cell datasets, ik kan een uitgebreide pipeline bieden van kwaliteitscontrole tot geavanceerde downstream analyse.

Ik bied:

• Kwaliteitscontrole (FastQC, MultiQC)
• Aligneren & kwantificeren
• Differentieel expressie/toegankelijkheid analyse
• Peak calling (voor ATAC-seq)
• Dimensionaliteitsreductie, clustering, cell typing (voor scRNA-seq)
• Visualisatie (heatmaps, PCA, volcano plots, UMAP/tSNE)
• Functionele verrijking (GO/KEGG)
• Aangepaste plots voor publicatie

Tools die ik gebruik: R, Seurat, DESeq2, edgeR, MACS2, Galaxy, Bioconductor, Scanpy

Laten we je ruwe data omzetten in biologische inzichten!