Ik analyseer genomische en biologische data
Over deze dienst
Heb je complexe biologische of genomische data nodig die nauwkeurig en duidelijk worden geanalyseerd? Ik bied wetenschappelijke data-analyse en bioinformatica diensten aan, met schone, reproduceerbare resultaten en duidelijke interpretatie van de bevindingen.
Elk project omvat een grondige analyse van je biologische dataset met geschikte statistische methoden, goed gedocumenteerde resultaten en visualisaties die je bevindingen effectief communiceren. Of je nu SNP-analyse, VCF-bestandsanalyse, variant calling, genexpressie-analyse of NGS-data verwerking nodig hebt, ik pas de aanpak aan op jouw specifieke onderzoeksvraag.
Alle bioinformatica analyses worden uitgevoerd met R, Python en Jupyter Notebook, met volledige documentatie om ervoor te zorgen dat elke stap transparant en reproduceerbaar is. Ik heb ervaring met next-generation sequencing data, genomische data-analyse en workflows in computational biology voor verschillende biologische datasets.
Mijn MSc in Biotechnologie geeft me de wetenschappelijke basis om rigoureuze, goed gedocumenteerde DNA- en genoomsequentie-analyses te leveren die klaar zijn voor publicatie of verder onderzoek.
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Met welke soorten gegevens kun je werken?
Ik werk met genomische data bestanden, waaronder VCF en parquet bestanden, SNP-chip data, biologische datasets in CSV of Excel formaat en andere gestructureerde wetenschappelijke dataformaten.
Zal ik je analyse kunnen reproduceren?
Ja. Alle code en analystappen worden volledig gedocumenteerd zodat je de resultaten kunt reproduceren of onafhankelijk kunt verifiëren.
Welke hulpmiddelen gebruik je?
Ik gebruik voornamelijk Python, R en Jupyter Notebook voor analyse en visualisatie.
Kunt u overweg met grote datasets?
Ja. Ik heb ervaring met grote biologische datasets en gebruik geschikte tools om data te verwerken die de standaard geheugenlimieten overschrijdt.
Kun je de resultaten uitleggen als ik geen specialist ben?
Ja. Ik lever resultaten met een uitleg in eenvoudige taal naast de technische output, zodat de bevindingen toegankelijk zijn ongeacht je achtergrond.
