Ik voer rnaseq differentiële expressie analyse uit op je dataset

die professionele analyse nodig heeft?

Ik analyseer je RNA-seq dataset en identificeer

differentieel uitgedrukte genen met DESeq2, en lever

publicatieklare resultaten.

WAT IK BIED:

- Aligneren op referentiegenoom met HISAT2

- Differentiale expressie-analyse met DESeq2

- Volcano plot en heatmap van top DEGs

- Volledig HTML-analyserapport

- Schone, gedocumenteerde R- en Python-scripts

OPLEVERINGEN ZIJN:

- DESeq2 differentiale expressie resultaten

- GO Biological Process verrijkingsanalyse

- Reactome pathway analyse met klinische pathways

- Publicatieklare figuren

- Volledig HTML-rapport

MIJN ERVARING:

Ik heb een complete RNA-seq pipeline gebouwd die echte

borstkanker genomica data analyseert van NCBI dataset

PRJNA432903. Ik heb 2298 significante DEGs geïdentificeerd met

PC1 die 86% van de variantie verklaart.

WAT IK VAN JOU NODIG HEB:

- Ruwe FASTQ-bestanden of vooraf verwerkte count matrix

- Referentiegenoom of organisatienaam

- Experimentele condities en monstersinformatie

GEREEDSCHAPPEN GEBRUIKT:

R, DESeq2, HISAT2, featureCounts, Python, Bash,

Git, Linux, ggplot2, EnhancedVolcano

Bestel nu en ontvang nauwkeurige, reproduceerbare

bioinformatica resultaten die worden geleverd op