Ik voer single cell rna seq analyse uit en celtype annotatie

Heb je single-cell RNA-seq data die professionele analyse en identificatie van celtypes nodig heeft?

Ik analyseer je scRNA-seq dataset met Seurat

en lever een volledige celtype annotatie met

publicatieklare visualisaties.

WAT JE KRIJGT:

- Kwaliteitscontrole en filtering van cellen van lage kwaliteit

- Normalisatie en schaling

- PCA dimensionaliteitsreductie

- Grafiekgebaseerde clustering

- UMAP visualisatie

- Marker gen identificatie per cluster

- Biologische celtype annotatie

- Volledig analyseverslag

MIJN ERVARING:

Ik heb 2.700 menselijke PBMC's geanalyseerd en 9 verschillende

celpopulaties geïdentificeerd, waaronder T-cellen, B-cellen, NK-cellen,

Monocyten, Dendritische cellen en Bloedplaatjes met Seurat.

Volledig pipeline beschikbaar op GitHub.

WAT IK VAN JOU NODIG HEB:

- 10X Genomics outputbestanden (barcodes, features, matrix)

 OF verwerkte count matrix

- Organism naam (mens, muis, etc.)

- Elke bekende biologie over je sample

GEREEDSCHAPPEN: R, Seurat, ggplot2, dplyr, UMAP,

    PCA, Git, Linux

Stuur me een bericht voordat je bestelt om je dataset te bespreken.

Ik bevestig eerst de haalbaarheid.