Ik analyseer je rnaseq data met deseq2 en publicatieklare figuren
Bioinformaticus RNA seq en Single Cell Analyse Bioinformatics Analist
Over deze dienst
Heb je RNA-seq data maar geen tijd (of pipeline) om het te analyseren? Ik zet je counts of ruwe reads om in duidelijke, publicatieklare resultaten. Ik ben een biotechnologieonderzoeker met praktische ervaring in wet-lab werk en een openbaar GitHub-portfolio, inclusief een RNA-seq pipeline (HISAT2, featureCounts, DESeq2) op luchtweggladde spiercellen behandeld met dexamethason.
WAT JE KRIJGT - Differential expressie analyse met DESeq2 - QC, PCA, volcano plots en heatmaps - GO/KEGG pad-enrichments (Standaard en Premium) - Schone resultaten tabellen (Excel/CSV) - Reproduceerbare code en een README
WAT IK VAN JOU NODIG HEB - Ruwe counts matrix of FASTQ-bestanden - Sample metadata (groepen/condities) - Organisme en referentiegenoom - Vergelijkingen die je wilt (bijvoorbeeld behandeld vs controle)
WAAROM MET MIJ WERKEN - Duidelijke communicatie en op tijd leveren - Figuren geformatteerd voor papers en presentaties - Jouw data blijft vertrouwelijk. Weet je niet welke package het beste past? Stuur me een bericht voordat je bestelt met een korte beschrijving van je experiment en ik adviseer je de beste optie.
Expertise:
Statistieken
•
Clusteranalyse
•
Regressietesten
Technologie:
Excel
•
MATLAB
Programmeertaal:
Python
•
R

