Ik analyseer bulk rna seq en genexpressie data
Bioinformatica-analist RNA seq Wetenschappelijke data visualisatie
Over deze dienst
Zet je human bulk RNA-seq of genexpressie data om in duidelijke, betrouwbare en publicatieklare resultaten.
Ik help onderzoekers, laboratoria en biotech-teams complexe expressiematrices om te zetten in goed georganiseerde biologische inzichten met behulp van R en Bioconductor workflows die op elke studieopzet zijn afgestemd.
De diensten kunnen onder andere omvatten:
- Controle van input, metadata en sample-identiteit
- Kwaliteitscontrole, beoordeling van library-grootte, PCA en samplediagnostiek
- Filtering, normalisatie en differentiële expressie analyse
- Volledige resultaat tabellen, volcano plots en publicatieklare figuren
- DEG heatmaps en GO, Reactome en KEGG pathway analyse
- Sensitiviteits- en concordantieanalyse voor geavanceerde projecten
- Duidelijke methoden, samenvatting van resultaten en gestructureerde QA-registraties
Je ontvangt zorgvuldig georganiseerde outputs die makkelijk te beoordelen, interpreteren en gebruiken zijn in rapporten, presentaties, manuscripten of vervolganalyses. Ik focus op statistische duidelijkheid, hoogwaardige visualisaties en heldere communicatie gedurende het hele project.
Neem vooraf contact met me op voordat je bestelt, zodat ik je data, onderzoeksvraag en gewenste vergelijkingen kan begrijpen.
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke bestanden moet ik aanleveren?
Gelieve een gene-niveau telling of expressiematrix, sample metadata, groepslabels, gene ID-type en de benodigde vergelijkingen aan te leveren. Een korte beschrijving van je onderzoeksvraag is ook handig.
Verwerk je ruwe FASTQ-bestanden?
Deze dienst richt zich op downstream analyse van gene-telling matrices of gevalideerde expressiematrices. Raw FASTQ kwaliteitscontrole, uitlijning en kwantificering vereisen een aparte aangepaste scope.
Welk pakket moet ik kiezen?
Basis dekt gerichte QC en differentiële expressie. Standaard voegt diagnostiek, een DEG heatmap en pathway analyse toe. Premium ondersteunt grotere studies, tot twee contrasten, sensitiviteitsanalyse en uitgebreide QA.
Zijn R- of Python-scripts inbegrepen?
Reproduceerbare R- of Python-scripts en notebooks zijn niet standaard inbegrepen. Ze kunnen als betaalde extra worden geleverd na beoordeling van de data, omgeving en benodigde code scope.
Kun je gekoppelde of complexe studieontwerpen analyseren?
Ja, eenvoudige gekoppelde en niet-gekoppelde vergelijkingen worden ondersteund in het juiste pakket. Multi-factor, interactie, longitudinaal of andere complexe ontwerpen vereisen een haalbaarheidsbeoordeling en een aangepaste offerte.
Kun je significante genen of pathways garanderen?
Statistische significantie hangt af van de data, steekproefgrootte en biologische effect. Ik lever volledige, transparante resultaten en rapporteer duidelijk zowel significante als niet-significante bevindingen.
Wat zal ik ontvangen?
Afhankelijk van je pakket ontvang je georganiseerde resultaatstabellen, hoge-resolutie figuren, methoden, een samenvatting van resultaten en QA-registraties. Geavanceerde pakketten bevatten pathway- en sensitiviteitsanalyses.
Wat wordt gedekt door een revisie?
Een revisie omvat correcties, opmaakwijzigingen of verduidelijkingen binnen de afgesproken analyse scope. Nieuwe datasets, vergelijkingen, methoden of analysemodule vereisen een aangepaste extra of offerte.

