Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik analyseer menselijke single cell rna seq data met celannotatie
Bioinformatica-analist RNA seq Wetenschappelijke data visualisatie
Bioinformatics-analist die zich specialiseert in menselijke bulk RNA-seq, genexpressieanalyse en wetenschappelijke data visualisatie. Ik help onderzoekers om tellingsmatrices en metadata om te zetten ...
Over deze dienst
Zet je menselijke single-cell RNA-seq data om in duidelijke, gestructureerde en publicatieklare biologische inzichten.
Ik bied een zorgvuldig, identiteit-bewuste analyseworkflow die de relatie tussen cellen, monsters en proefpersonen gedurende het hele project behoudt. Je resultaten worden geleverd met hoogwaardige figuren, georganiseerde tabellen en duidelijke wetenschappelijke interpretaties.
Afhankelijk van je gekozen pakket omvat de analyse:
Validatie van count matrix en metadata
Quality control per monster
Detectie en filtering van doubletten
Normalisatie, PCA, UMAP en clustering
Integratie en beoordeling van batch-effecten
Identificatie van marker genen
Evidence-based celtype-annotatie
Publicatieklare UMAP, dot plots, heatmaps
Georganiseerde H5AD-bestanden en resultattabellen
Subject-bewuste pseudobulk differentiële expressie
Analyse van celcompositie per monster
Gestructureerd analyseverslag en kwaliteitsregistraties
Deze dienst is ideaal voor menselijke multi-sample single-cell studies in biomedisch, farmaceutisch en biotechnologisch onderzoek. Ik combineer bioinformatica-analyse met wetenschappelijke visualisatie om resultaten te bieden die duidelijk, betrouwbaar en klaar voor onderzoeksrapporten, presentaties en publicatievoorbereiding zijn.
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke invoergegevens accepteer je?
Ik werk met een menselijke integer gen-per-cel count matrix en bijbehorende metadata. Geef alsjeblieft cel-naar-monster mapping, subject-ID's, conditielabels en gen-identifiers waar beschikbaar.
Verwerk je ruwe FASTQ-bestanden?
Deze pakketten beginnen vanaf een integer count matrix. Raw FASTQ alignment en kwantificatie zijn niet inbegrepen. Neem contact op als je data zich nog in een eerdere verwerkingsfase bevinden.
Hoe voer je celtype-annotatie uit?
Ik gebruik marker genen, expressiepatronen in clusters en beschikbare biologische referenties. Annotatie is evidence-based, en onzekere of conflicterende populaties worden duidelijk geïdentificeerd voor review.
Hoe wordt differentiële expressie geanalyseerd?
Wanneer het studieontwerp het ondersteunt, gebruikt het Premium pakket subject-bewuste pseudobulk analyse. Cellen bieden meetdiepte, terwijl biologische proefpersonen de statistische replicatie bepalen.
Zijn reproduceerbare scripts inbegrepen?
R- of Python-scripts en notebooks zijn standaard niet inbegrepen. Reproduceerbare scripts kunnen als betaalde Extra worden gekocht nadat de scope, datavorm en benodigde omgeving zijn beoordeeld.
Kun je specifieke markers of significante resultaten garanderen?
Resultaten hangen af van datakwaliteit, studieontwerp, biologische variatie en monstersampling. Ik bied een rigoureuze en transparante analyse, maar specifieke markers of statistische significantie kunnen niet worden gegarandeerd.
Welke analyses zijn niet inbegrepen in deze pakketten?
Ruimtelijke transcriptomics, scATAC-seq, multiome, traject, cel-cel communicatie, regulatienetwerk en CNV-analyses vereisen een aparte haalbaarheids- en prijsbeoordeling.
