Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik doe moleculaire docking, virtueel screening en MD-simulatie
Bioinformaticus Omics Data Analist
Hoi, ik ben Maghooz Khan, een professionele bioinformaticus en AI-ontwikkelaar. Ik werk aan genomica, metagenomics, RNA-Seq, epigenetica, methylatie, CNV-analyse en AI-gebaseerde bioinformatics projec...
Over deze dienst
Heb je moleculaire docking, virtueel screening, MD-simulatie of protein-ligand interactie-analyse nodig voor je onderzoek?
Ik help je bij het bestuderen van ligand-proteïne of proteïne-proteïne interacties met betrouwbare workflows voor computational drug discovery.
De diensten omvatten:
- Ligand/proteïne voorbereiding
- Moleculaire docking en virtueel screening
- Dockingscore en binding pose-analyse
- 2D/3D interactie diagrammen
- Opzetten/analyse van molecular dynamics simulaties
- Interpretatie van RMSD, RMSF, Rg, SASA, H-bond en MM/PBSA-stijl
- Wetenschappelijk rapport, tabellen en figuren klaar voor publicatie
Tools kunnen onder andere omvatten AutoDock Vina, PyRx, Chimera/ChimeraX, Discovery Studio, GROMACS, VMD, Pymol en gerelateerde tools afhankelijk van je project.
Stuur me een bericht voordat je bestelt, zodat ik je proteïne, liganden, aantal verbindingen, simulatieperiode, planning en verwachte deliverables kan controleren.
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke informatie heeft u nodig voordat u met het project begint?
Ik heb de structuur van het target proteïne of PDB ID, ligandstructuren of PubChem IDs, aantal verbindingen, benodigde docking/MD-tools indien aanwezig, projectdoel en verwachte deliverables zoals rapport, figuren, tabellen of manuscript-achtige resultaten nodig.
Kun je werken als ik alleen ligandidnamen of PubChem IDs heb?
Ja. Ik kan ligandstructuren ophalen uit PubChem of andere openbare databases, ze voorbereiden en gebruiken voor docking of virtueel screening. Voor aangepaste of niet-gepubliceerde verbindingen, stuur SDF-, MOL-, MOL2-, PDB- of SMILES-bestanden.
Welke soorten docking-analyse worden inbegrepen?
Afhankelijk van het pakket kan ik docking scores, beste binding poses, gerankte ligand tabellen, 2D/3D interactie diagrammen, waterstofbruggen, hydrofobe interacties, bespreking van interacties in het actieve centrum en wetenschappelijke interpretatie bieden.
Lever je figuren en tabellen die klaar zijn voor publicatie?
Ja. Ik kan schone figuren en tabellen maken voor thesis, manuscript, presentatie of rapport, inclusief docking interactie-afbeeldingen, binding affiniteit tabellen, pose vergelijkingsfiguren en MD-analyseplots waar nodig.
Kun je een specifiek onderzoeksartikel of protocol volgen?
Ja. Als je een referentieartikel, protocol of tijdschriftvereiste hebt, deel dat dan voordat je bestelt. Ik kan de workflow aanpassen aan de benodigde tools, parameters, docking grid, liganden, proteïne voorbereiding en analyse stijl waar mogelijk.
Welke MD-simulatie-analyses kun je bieden?
Voor MD-projecten kan ik analyses bieden zoals RMSD, RMSF, radius of gyration, SASA, waterstofbruggen, energietermen, afstandsanalyse, trajectvisualisatie en interpretatie van complexstabiliteit afhankelijk van het pakket en de scope van het project.
Kun je protein–protein docking uitvoeren of alleen protein–ligand docking?
Ik ondersteun zowel protein–ligand als protein–protein docking, afhankelijk van het project. Deel de structuren, doelinteractie en verwachte analyse zodat ik de beste workflow kan bevestigen voordat ik begin.
Waarom een bericht sturen voordat u bestelt?
Elk project verschilt in proteïne grootte, ligand aantal, tools, MD-lengte en rapportbehoeften, dus de scope moet eerst worden gecontroleerd.
