Ik annotatieer phage genomes en phage eiwitten

Sommige informatie is automatisch vertaald.

India

Ik spreek Kannada, Engels, Hindi, Tamil, Telugu

Onderzoeksmedewerker

Hallo! Ik ben Manjunath, een master in Moleculaire Biologie met praktische ervaring in microbiologie, bacteriofaagonderzoek en moleculaire biologie. Ik heb ervaring met genome-analyse, genannotatie, S...

Lees meer

Over deze dienst

Phage genome & eiwit annotatie

Heb je een bacteriofaag genome of eiwitsequenties die professionele bioinformatica-annotatie nodig hebben? Ik kan je helpen bij het identificeren van genen, het voorspellen van eiwitfuncties en het karakteriseren van je phage genome met behulp van gevestigde bioinformatica-tools en databases.

De diensten omvatten:

Phage genome annotatie & ORF/CDS voorspelling

Genen identificatie en functionele annotatie

Voorspelling van phage eiwitfunctie

Similariteitsanalyse op basis van BLAST

Identificatie van geconserveerde domeinen en eiwitfamilies

Structuur-, replicatie-, lysis- en DNA-metabolisme-eiwit identificatie

Karakterisering van hypothetische eiwitten

tRNA en andere genomische kenmerken identificatie

Vergelijkende analyse van phage genomes

Genoomkaarten en annotatietabellen

Tools/databases: NCBI BLAST, HMMER, Pfam, InterPro, UniProt, PHROGs, Prokka, PHANOTATE, VIBRANT en andere relevante bronnen.

Leveringen: Geannoteerd genome, eiwitannotatietabel, functionele classificatie, analyseresultaten, samenvatting van genomische kenmerken en publicatieklare figuren/tabellen waar nodig.

Neem contact met mij op voordat je bestelt om je genome, eiwitsequenties of specifieke onderzoeksbehoeften te bespreken.

Lees meer