Ik zal docking en moleculaire dynamische simulatie uitvoeren
Biotechnologie, Bio-informatica en specialist in wetenschappelijke content
Over deze dienst
Het potentieel van je onderzoek ontsluiten met In Silico Drug Design
Ben je op zoek naar een ervaren bioinformaticus om je drug discovery en biotechnologie projecten te versnellen? Ik bied expert-level computationele diensten aan in moleculaire docking en moleculaire dynamica (MD) simulaties om je te helpen eiwit-ligand interacties te begrijpen en veelbelovende drugkandidaten te identificeren.
Met vier jaar ervaring en een sterke achtergrond in bioinformatica en computational biology kan ik je ruwe data omzetten in waardevolle inzichten.
Wat ik aanbied,
a. Multiple Sequence Alignment
b. Pairwise Sequence Alignment
c. Dynamic Programming
d. Gen voorspelling
e. 3D structuur voorspelling
f. Fylogenetische boom
g. Moleculaire docking analyse:
- Eiwith- ligand docking
- Virtuele screening
- Binding site analyse
g. Moleculaire dynamica (MD) simulatie:
- Systeem setup en equilibratie
- MD simulaties uitvoeren
- Trajectanalyse
Software en tools waarin ik bedreven ben:
- Aligning tools (BLAST, Needle, T-Coffee etc.)
- I-TASSER, Modeller en Machine Learning algoritmes
- AutoDock Vina en AutoDock Tools
- Gromacs
- Chimera en Pymol voor visualisatie
- Ubuntu voor scripting
Neem vandaag nog contact met me op voor een gesprek.
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke informatie heb je nodig om aan de slag te gaan?
Ik heb ruwe data bestanden nodig (PDB ID of sequentie van eiwit, ligand naam of ID), een gedetailleerde omschrijving van de projectdoelstellingen, en eventuele specifieke wensen of eisen voor de analyse.
Hoe waarborg je de kwaliteit van de analyse?
Ik gebruik nauwkeurige software en tools om de analyse uit te voeren. Daarnaast lever ik gedetailleerde rapporten en alle benodigde bestanden tijdens het docken en MD-simulaties. Ook lever ik hoogwaardige afbeeldingen voor publicaties.

