Meer dan 3 jaar gespecialiseerde ervaring in bacteriële genomica, bio-informatica en AI/ML-integratie
Ontwikkeld end-to-end pipelines voor bacteriële genoomassemblage, annotatie en vergelijkende genomica
Praktische expertise met tools zoals BLAST, MEGA, iTOL, BPGA en databases zoals NCBI, EnsemblBacteria
Diensten aangeboden Bacteriële Genoomanalyse
- Uitgebreide bacteriële genoomanalyse met BLAST, MEGA, iTOL en pan-genoomtools (bijvoorbeeld BPGA)
- Constructie en annotatie van fylogenetische bomen en visualisatie met iTOL
- Pan-genoomprofilering (kern-, accessoire-, unieke genanalyse) over meerdere bacteriële stammen
- Integratie en analyse van GEO-datasets voor bacteriële transcriptomics
- Verrijkingsanalyse (GO/KEGG) voor functionele interpretatie van bacteriële genensets
- Ontwikkeling van maatwerk ML-pipelines om biomarkers, resistentiegenen of evolutionaire patronen te identificeren
- Schaalbare pipelines voor vergelijkende genomica, drugdoelontdekking en microbiële classificatie