Ik verzorg bioinformatics werk dat saai is

Bioinformatica werk heeft veel saaie uitvoeringsstappen die niet in de methodesectie van een paper staan, maar wel uren van je tijd opslokken:

- QC uitvoeren op ruwe sequencing bestanden en het rapport interpreteren

- Rommelige bestandsnamen ontrafelen bij tientallen/honderden samples

- Een pipeline stap die steeds faalt (Snakemake, Nextflow of een aangepaste script) oplossen door format mismatches of omgevingsproblemen.

- Metadata formatteren voor GEO/SRA indiening

- Een lijst met gen/variant cross-referencen met databases en een overzichtelijke, geannoteerde samenvatting maken

Dit is het werk dat makkelijk te beschrijven is, maar saai en foutgevoelig om daadwerkelijk uit te voeren, vooral bij echte, rommelige, volledige bestanden. Ik heb praktische ervaring met het draaien van deze tools en het oplossen van de onvermijdelijke randgevallen.

Vertel me wat er stukgaat of wat gedaan moet worden, en stuur een voorbeeld van je data. Ik vertel je precies wat ik kan leveren en hoe snel.