Ik audit jouw moleculaire docking-protocol en bindingsposities

Worden jouw dockingposities en ranglijsten ondersteund door een reproduceerbaar protocol? Ik beoordeel aangeleverde docking-methoden en outputs voor geneesmiddelontdekking, waarbij ik methodologische hiaten en interpretatiebeperkingen identificeer.

BASIS: één doelwit, één aangeleverd protocol en tot 10 posities. Ontvang een beknopte schriftelijke audit met beoordeling van voorbereidingen, protonatie-aannamen, rooster/instellingen, controles en gerapporteerde conclusies.

STANDAARD: tot 30 posities en 3 referenties, met nauwere evaluatie van geometrie, controles en rapportage.

PREMIUM: de standaardbeoordeling plus een afgebakend validatieplan en expliciete acceptatiecriteria.

Leveringen: een Engelstalig PDF-rapport, geprioriteerde problemen en praktische vervolgstappen. Eén revisie behandelt verduidelijking binnen de afgesproken scope.

Mijn achtergrond omvat onafhankelijk computationeel onderzoek en advies voor HDAC-onderzoek met Python, RDKit en ChEMBL.

Dit is een beoordeling van aangeleverd materiaal. Nieuwe docking-runs, MD, FEP, experimentele assays en garanties van binding, effectiviteit of selectiviteit zijn uitgesloten. Voorspellingen worden onderscheiden van experimenteel bewijs. Stuur mij aub een bericht met het doelwit, bestanden en onderzoeksvraag voordat je bestelt.