Ik analyseer je biologische strings, fasta, multifasta, fastq bestanden enzovoort

In bioinformatica-analyses waarbij het verwerken van biologische sequenties (DNA/RNA sequenties, aminozuur sequenties, enzovoort) nodig is, krijgen wetenschappers vaak te maken met een enorme hoeveelheid werk, omdat handmatig verwerken van bestanden vaak arbeidsintensief wordt. Hier wordt analyse-automatisering heel belangrijk; dit helpt om alle bestanden / monsters programmatisch te verwerken, waardoor de tijd en moeite die in het werk wordt gestoken aanzienlijk worden verminderd.

In dit project help ik bij het verwerken van je biologische sequenties / bestanden. Voorbeelden van processen zijn onder andere, maar niet beperkt tot:

Het formatteren van multi-fasta bestand headers naar handigere namen;

Het berekenen van GC-inhoud voor meerdere sequenties / genomen;

Het vertalen van meerdere DNA-sequenties naar eiwit en/of het terugvertalen van eiwit naar DNA-sequenties;

Het zoeken naar motieven / patronen door meerdere sequenties;

Het extraheren van geselecteerde velden / regio's uit bestanden;

Het verkrijgen van reverse complements voor meerdere sequenties;

Het annoteren van meerdere sequentiebestanden; enzovoort.

Neem gerust contact op met je taak, of deze nu hierboven staat of niet. Ik kijk uit naar je bericht. Bedankt.