Ik analyseer rna seq single cell en atac seq bioinformatica data

Sommige informatie is automatisch vertaald.

Pakistan

Ik spreek Engels, Duits

2 bestellingen voltooid

Bioinformatics en ML engineer RNA seq scRNA seq ATAC seq

Bioinformatics en machine learning engineer die zich specialiseert in RNA seq, single cell RNA seq, ATAC seq, genomics en biologische data-analyse. Ik zet ruwe sequencing data om in schone, reproducee...
Over deze dienst

Heb je RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq of multi-omics data nodig die op een duidelijke en reproduceerbare manier worden geanalyseerd?


Ik kan helpen met quality control, preprocessing, normalisatie, differentiële expressie, clustering, marker genes, pathway/enrichment analyse, interpretatie van ATAC peak/count, visualisatie en een korte samenvatting van de resultaten.


Tools en workflows kunnen onder andere R, Python, Bioconductor, DESeq2, Seurat, Scanpy, Jupyter, RStudio en Google Colab omvatten.


Typische opleveringen zijn schone resultattabellen, publicatie-achtige grafieken, reproduceerbare R/Python code of notebooks en beknopte interpretatie van belangrijke bevindingen.


Stuur me een bericht voordat je bestelt, zodat ik je datatypes, sample metadata, vergelijkingsgroepen, organisme/referentiegenoom en verwachte output kan bevestigen.



Programmeertaal:

Python

R

Technologie:

Jupyter-notitieboek

Overige

Type analyse:

Kwantitatieve analyse

statistische analyse

Expertise:

Experimentontwerp

Algoritmes

Statistieken

Tools:

RStudio

Google Colab

Overige

Gerelateerde tags