Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik voer MD-simulaties uit, moleculaire docking en data-analyse
Over deze dienst
Ik kan je helpen met:
Moleculaire docking en analyse van eiwit-ligand interacties
Post-simulatie analyse inclusief RMSD, RMSF, PCA en interactieanalyse
Markov State Models, correlatienetwerken en grafgebaseerde analyse
Computational drug discovery en de novo moleculaire ontwerp
Wetenschappelijke data-analyse met Python, R en MATLAB
Interpretatie en visualisatie van computational resultaten
Review en optimalisatie van workflows voor moleculaire modellering
Ik bied zorgvuldige, reproduceerbare analyses met duidelijke wetenschappelijke interpretatie en presentatieklare outputs.
Domein:
Machine learning
Expertise:
Representatieleren
•
Voorspellende analyse
Programmeertaal:
Python
•
R
•
MATLAB
Tools:
tensorflow
•
Excel
Technologie:
Python
•
PyTorch
•
scikit-learn
•
MATLAB
•
Pandas
•
RStudio
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke informatie heeft u nodig voordat u met het project begint?
Gelieve een korte beschrijving van je project te geven, het type analyse dat nodig is, beschikbare inputbestanden/-gegevens, softwarevoorkeuren indien aanwezig, en je verwachte opleveringen. Voor docking- of MD-projecten, graag ook eiwit-/ligandstructuren en bestaande simulatie- of dockingbestanden aanleveren.
Kun je bestaande MD-trajecten of dockingresultaten analyseren?
Ja. Ik kan aangeleverde trajecten, dockingposities, interactieprofielen en gerelateerde data analyseren, inclusief RMSD, RMSF, PCA, eiwit-ligand interacties, conformationle analyse en wetenschappelijke visualisatie.
Voer je moleculaire dynamicasimulaties vanaf nul uit?
Ja, maar afhankelijk van de beschikbare rekenkracht. Neem contact met me op voordat je een volledige MD-simulatie bestelt, zodat ik de scope, tijdlijn en kosten kan bevestigen.
Met welke software voor moleculaire modellering werk je?
Ik heb ervaring met AMBER en GROMACS voor moleculaire dynamicasimulaties, samen met moleculaire docking, PyMOL, RDKit, Python, R, MATLAB, Shell (scripting) en gerelateerde tools voor computational biology.
Kun je werken met meerdere liganden of eiwit–ligand complexen?
Ja, maar de workload hangt af van het aantal systemen en het type analyse dat nodig is. Neem eerst contact op voor projecten met meerdere liganden, grootschalige docking of meerdere MD-trajecten.
Zul je figuren en interpretaties van de resultaten leveren?
Ja. Afhankelijk van het gekozen pakket, kan ik duidelijke wetenschappelijke interpretatie, figuren van publicatie- of presentatiekwaliteit en een beknopte samenvatting van de belangrijkste bevindingen leveren.
Kun je helpen mijn computational workflow te reviewen of problemen op te lossen?
Ja. Ik kan workflows voor moleculaire docking, MD-simulatie of computational biology beoordelen, methodologische problemen identificeren, geschikte tools en parameters aanbevelen en helpen de reproduceerbaarheid te verbeteren.
Blijven mijn gegevens en onpubliceerde resultaten vertrouwelijk?
Ja. Klantgegevens, onpubliceerde resultaten, structuren en projectinformatie worden als vertrouwelijk behandeld en alleen gebruikt voor het voltooien van het afgesproken werk.
