Ik doe moleculaire docking voor drug discovery
Over deze dienst
Ben je bezig met drug discovery, targetvalidatie of
compound screening? Ik voer professionele moleculaire
docking en virtuele screening uit voor jouw onderzoeksproject.
WAAROM KIEZEN VOOR MIJ?
M.Tech Biotechnologie met praktische ervaring in CADD
Volledig virtueel screeningproject voltooid voor DMD-onderzoek
Vaardig in AutoDock Vina, PyMOL, Python, ChEMBL, ZINC
Snelle levering met duidelijke, publicatieklare resultaten
WAT IK DOE:
Protein structuur voorbereiden uit PDB-database
Actieve bindingsite identificeren en valideren
Compoundbibliotheken screenen (ChEMBL, ZINC, PubChem)
Moleculaire docking uitvoeren met AutoDock / AutoDock Vina
Compounds rangschikken op basis van binding affinity (ΔG scores)
Belangrijke bindingsresten en interactietypes analyseren
Protein-ligand complex visualiseren met PyMOL
Gestructureerde resultaten leveren met SAR-interpretatie
LEVERINGEN:
Docking-resultaatbestanden
Binding affinity rangschikkingslijst
PyMOL-interactieafbeeldingen
Samenvattend rapport
GEBRUIKTE GEREEDSCHAPPEN:
AutoDock Vina PyMOL Python ChEMBL ZINC PDB
Neem contact met mij op voordat je bestelt als je specifieke targets
of compoundbibliotheken hebt. Ik bevestig eerst de haalbaarheid.
Programmeertaal:
Python
•
R
Technologie:
Excel
•
Jupyter-notitieboek
•
MATLAB
•
Overige
Type analyse:
statistische analyse
•
Voorspellende analyse
Expertise:
Voorspelling
•
Statistieken
•
Overige
Tools:
RStudio
•
Google Colab
•
Overige

