Ik doe data-analyse voor wes rnaseq en verschillende genetica- en bioinformatica-projecten
Ik bouw digitale assemblagelijnen voor biologische data en analyseer de resultaten
Over deze dienst
Ik bied professionele bioinformatica-ondersteuning voor genomics, sequencing en genetica-gerelateerde projecten.
De diensten omvatten:
- Ontwikkeling en optimalisatie van aangepaste bioinformatica-pijplijnen
- Workflow-automatisering en scripting
- Variantverwerking en downstream analytische ondersteuning
- Data schoonmaken, preprocessing en formatteren
- Voorbereiding van datasets voor downstream statistische, machine learning- of AI-toepassingen
- In-silico ondersteuning voor genetica en moleculaire biologie onderzoeksvragen
- Analyse van diereninbreiding, fokpotentieel en genetische diversiteit
- Ondersteuning bij experimenteel ontwerp
- Statistische analyse
- Technisch en marktgericht onderzoek binnen genetica en bioinformatica
- Reproduceerbare workflow en omgeving setup
Technische tools en workflow-praktijken:
- Perl
- R
- Bash
- Conda
- Docker
Benadering:
- Duidelijke en professionele communicatie
- Reproduceerbare en goed gestructureerde workflows
- Wetenschappelijk onderbouwde, project-specifieke ondersteuning
Neem contact met mij op voordat je bestelt met een korte beschrijving van je project, datatypes en verwachte opleveringen, zodat ik het meest geschikte pakket kan aanbevelen.
Technologie:
RStudio
•
Overige
Expertise:
Experimentontwerp
•
Algoritmes
•
Statistieken
•
Overige
Programmeertaal:
R
•
Overige
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Met welke datatypes werk je?
Ik werk met WES, WGS, RNA-seq en genetica-gerelateerde datasets (bijvoorbeeld fastq, bam, vcf, fam, bed, bim, etc.).
Kun je aangepaste pipelines bouwen?
Ja, ik ondersteun bij het ontwerpen van aangepaste pipelines, scripting en workflowverbetering.
Gebruik je reproduceerbare tools?
Ja, ik werk met Conda en Docker voor reproduceerbare omgevingen.
Bied je ook statistische analyse aan?
Ja, inclusief statistische analyse en statistische power analyse.
Help je met dieren genetica projecten?
Ja, inclusief inbreeding, fokpotentieel en gerelateerde analyses.
