Ik voer RNA-seq differentiële expressie analyse uit met deseq2 of edger

Sommige informatie is automatisch vertaald.
Nitchawat

Thailand

Ik spreek Engels

Ik analyseer je proteomics LC MSMS data en lever publicatieklare resultaten

Universiteitsonderzoeker gespecialiseerd in LC-MS/MS proteomics, transcriptomics en multi-omics integratie. Ik publiceer in tijdschriften zoals Scientific Reports (Nature) en werk dagelijks met MaxQua...
Lees meer
Over deze dienst

Heb je hulp nodig met je RNA-seq data? Ik ben een universitair onderzoeker gepubliceerd in Scientific Reports (Nature), gespecialiseerd in multi-omics analyse voor biomarker ontdekking.


Ik werk dagelijks met DESeq2, edgeR en limma, niet alleen voor twee-groep vergelijkingen, maar ook voor complexe ontwerpen: gekoppelde monsters, tijdreeksen, multi-factor experimenten en batch-effecten.


Wat ik aanbied:

Kwaliteitsfiltering en normalisatie

Differentiële expressie analyse (DESeq2/edgeR)

Volcano plots, heatmaps, MA plots, PCA van publicatiewaarde

Gene set enrichment en pathway analyse (GO, KEGG, GSEA)

R scripts inbegrepen in Standard & Premium pakketten


Ik werk met: count matrices van featureCounts, HTSeq, STAR, Salmon of elk standaard pipeline.


Opmerking: Basic pakket dekt alleen QC en exploratieve analyse, geen differentiële testing.

Lees meer
perform rnaseq differential expression analysis with deseq2 or edger
Volledig scherm
perform rnaseq differential expression analysis with deseq2 or edger
Volledig scherm
Volledig scherm
Bekijk presentatie
perform rnaseq differential expression analysis with deseq2 or edgerperform rnaseq differential expression analysis with deseq2 or edgerperform rnaseq differential expression analysis with deseq2 or edgerperform rnaseq differential expression analysis with deseq2 or edger

Technologie:

RStudio

•

Overige

Type analyse:

Kwantitatieve analyse

•

Statistische analyse

+2 meer

Expertise:

Experimentontwerp

•

Statistieken

Programmeertaal:

Python

•

R

Gerelateerde tags