Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik voorspel eiwitstructuur met alphafold en voer docking analyse uit
Cv, CV en motivatiebrief schrijver, wetenschapper en academisch specialist
Ik help studenten, onderzoekers en professionals op twee manieren: het maken van duidelijke, ATS-vriendelijke cv’s, sollicitatiebrieven en resumé’s, en het leveren van AlphaFold-gebaseerde eiwitstruct...
Over deze dienst
Heb je een 3D-structuur nodig voor een eiwit dat je bestudeert, maar bestaat er geen experimentele structuur? Ik gebruik AlphaFold (via ColabFold) om nauwkeurige 3D-eiwitstructuren te voorspellen rechtstreeks uit je aminozuurvolgorde, plus optionele moleculaire docking en overzichtelijke visualisaties.
Als student Microbiologie en Moleculaire Genetica begrijp ik de biologie achter de data, niet alleen de software, dus ik kan je helpen bij het interpreteren van de resultaten, niet alleen het genereren van bestanden.
Wat je krijgt:
- Een voorspelde 3D-structuur (PDB-bestand) van je volgorde
- Confidence scores (pLDDT) uitgelegd in eenvoudige taal
- Optionele docking analyse met een ligand of tweede eiwit
- Schoon visualisatiebeeld dat geschikt is voor rapporten of presentaties
- Broncode en een schriftelijke samenvatting op hogere tiers
Belangrijk: voorspelde structuren zijn computationele schattingen, het beste voor onderzoek, coursework en hypothesevorming. Voor publicatie of klinische zekerheid wordt nog steeds experimentele validatie aanbevolen, en ik ben altijd eerlijk over de confidence levels.
Stuur me een bericht met je volgorde of PDB ID en wat je wilt weten. Ik help je graag voordat je bestelt!
Programmeertaal:
Python
•
R
•
Colab
Frameworks:
Overige
API's:
Overige
Tools:
Jupyter-notitieboek
•
Colab
•
Overige
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Hoe nauwkeurig is de voorspelling van AlphaFold?
Zeer nauwkeurig voor veel eiwitten, vaak bijna experimentele kwaliteit. Ik rapporteer altijd de confidence score (pLDDT) zodat je weet hoe betrouwbaar elk deel van de structuur is.
Is dit een vervanging voor experimentele structuurvaststelling?
Nee — het is een sterk startpunt voor onderzoek en hypothesevorming, maar publicatie of klinisch gebruik vereist meestal nog steeds experimentele validatie (X-ray/cryo-EM).
Wat is het verschil tussen de pakketten?
Structure Prediction geeft je het kern 3D-model. Prediction + Docking voegt interactieanalyse toe met een ligand of eiwit. Full Analysis Package bevat alles plus broncode en een gedetailleerd schriftelijk rapport.
Welke bestandsformaten krijg ik?
Een PDB-bestand voor de structuur, PNG/JPG visualisatiebeelden, en (op Standard/Premium) een schriftelijke samenvatting als PDF of Word.
Kun je grote eiwitten of eiwitcomplexen aan?
Ja, binnen redelijkheid — stuur me een bericht met je volgordelengte voordat je bestelt, zodat ik de haalbaarheid en doorlooptijd kan bevestigen.
Bied je dit ook aan voor studenten met een beperkt budget?
Ja — het Structure Prediction pakket is geprijsd voor coursework en studentgebruik.
