Ik voer ngs data-analyse, variantinterpretatie en model uit

Sommige informatie is automatisch vertaald.

India

Ik spreek Engels

Bio-informatie

Ik ben een bioinformatica professional met een stevige achtergrond in computationele biologie, genomica en workflow-automatisering. Ik ben bedreven in het analyseren van high-throughput NGS data en he...
Over deze dienst

Ben je op zoek naar een gespecialiseerde wetenschapper voor complexe biologische data? Met een M.Sc. in Bioinformatica bied ik geavanceerde analyses aan op het gebied van genomica, geneesmiddelenontwikkeling en AI. Ik zet ruwe data om in inzichten die klaar zijn voor publicatie.

Genomica & NGS:

  • End-to-end pipelines (WES/WGS/RNA-Seq) via Nextflow/Snakemake.
  • Clinische variant calling (ACMG) & annotatie (VEP/GATK/PCGR).
  • Interactieve dashboards voor genenpanel en laboratoriumgegevens.

Geneesmiddelenontwikkeling & Structurele Biologie:

  • Moleculaire Docking (Proteïne-Ligand/Proteïne-Proteïne) & virtuele screening.
  • Binding affiniteit analyse & moleculaire dynamica (MD) setup.

Single-Cell Analyse (scRNA-seq):

  • QC, clustering & trajectanalyse met Seurat of Scanpy.
  • Celtype-annotatie, spatial transcriptomics & differentiële expressie.

️ AI & Radiogenomics:

  • Deep Learning voor medische beeldvorming (CT/MRI) & Radiomics.
  • Geautomatiseerde hematologieslide-analyse & celclassificatie.

Technische stack: Python, R, Bash, Docker, Conda, AWS/GCP.

Waarom voor mij kiezen?

  1. Reproduceerbaarheid: Schone, gedocumenteerde code en Docker-omgevingen.
  2. Wetenschappelijke nauwkeurigheid: Resultaten gebaseerd op diepgaande biologische context.
  3. Aanpassing: Op maat gemaakte oplossingen voor unieke onderzoeksdoelen.

OPMERKING: Elk project is uniek. Stuur gerust een bericht

Domein:

Machine learning

Computer Vision

Expertise:

Afbeeldingenverwerking

Classificatie

Stemmingsanalyse

Programmeertaal:

Python

R

MATLAB

SQL

Colab

Tools:

Jupyter-notitieboek

opencv

OpenNN

tensorflow

Excel

Colab

Technologie:

Python

R

PyTorch

Google ML Kit

scikit-learn

Modellen en methoden:

Machine learning

Deep learning