Ik voer GPU-versnelde moleculaire dynamica simulaties uit met gromacs en lammps

Ik help je met het uitvoeren, oplossen van problemen en analyseren van moleculaire dynamica simulaties met GROMACS of LAMMPS.

Of je simulatie nu faalt, te langzaam is, of je volledige analyse nodig hebt, ik kan het hele proces van setup tot resultaten verzorgen.

Wat ik aanbied:

• Simulatie setup (topologie, box, solvatatie)
• Energieminimalisatie en equilibratie
• Productie MD runs (CPU/GPU versneld)
• Fouten in GROMACS of LAMMPS scripts oplossen
• Prestatie optimalisatie (GPU versnelling)
• Trajectanalyse inclusief:
• RMSD
• RMSF
• PCA
• Energie grafieken
• Visualisatie en grafiekgeneratie

Tools:

• GROMACS
• LAMMPS
• Python (analyse scripts)
• VMD / visualisatietools

Waarom voor mij kiezen:

• Ervaring met complexe systemen (polymeren, biomoleculen)
• Snel en betrouwbaar leveren
• Duidelijke communicatie en updates
• Neem contact met mij op voordat je een dienst bestelt om je project te bespreken.