Ik voer chemoinformatica analyse uit en moleculaire data verwerking
Over deze dienst
Ik verwerk en visualiseer je chemische data snel en nauwkeurig met Python & RDKit, voor drug discovery of onderzoek.
Wat ik kan doen:
- SMILES/SDF/CSV omzetten naar Excel rapporten
- Belangrijke descriptors berekenen (MW, LogP, TPSA, HBA, HBD)
- Lipinski's Rule of Five filters toepassen
- Fingerprints genereren & gelijkenis zoeken
- Gelijkenis heatmaps en chemische diversiteit grafieken maken
- Herbruikbare Jupyter notebooks met volledige code bouwen
Waarom ik?
- Master in Organische Chemie (Shanghai University + SIOC, CAS)
- 2 SCI-publicaties over asymmetrische Heck-reactie
- Meer dan 4 jaar ervaring in het selecteren van drug-achtige bouwstenen
- Python (RDKit, Pandas, scikit-learn)
Pakketten voor verschillende molecuulgroottes. Stuur me een bericht voor maatwerk.
Wat ik van jou nodig heb:
- Molecuulbestand (SMILES, CSV, of SDF)
- Korte omschrijving van je doel
Bestel nu of neem contact op!
Domein:
Machine learning
•
Overige
Expertise:
Classificatie
•
Voorspellende analyse
Programmeertaal:
Python
Tools:
Jupyter-notitieboek
•
Excel
•
Overige
Technologie:
Python
•
scikit-learn
•
Jupyter-notitieboek
•
Pandas
•
Excel
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Welke bestandsformaten worden geaccepteerd?
Ik accepteer lijsten met SMILES (CSV/Excel/TXT), SDF-bestanden of elk tekstbestand met een SMILES-kolom. Laat me gewoon weten wat de kolomnaam is als deze niet standaard is.
Kun je een groot aantal moleculen verwerken?
Ja, mijn pipeline is geoptimaliseerd voor tot 5000 moleculen in het Premium pakket. Voor grotere bibliotheken neem ik eerst contact met je op voor een aangepaste offerte.
Moet ik Python of RDKit kennen om jouw service te gebruiken?
Helemaal niet. Je levert gewoon je moleculaire bestand aan en vertelt me welke analyse je nodig hebt. Ik lever de resultaten in Excel of als een kant-en-klare Jupyter notebook – geen codering nodig van jouw kant.
Kun je de analyse aanpassen aan mijn specifieke projectbehoeften, zelfs buiten standaard cheminformatica?
Absoluut. Als je een unieke dataset hebt (bijvoorbeeld reactiedata, spectroscopische data of andere chemische/biologische tabellen) of een specifieke visualisatie of aangepaste Python-script nodig hebt, stuur me dan een bericht met details. Ik help je graag met een op maat gemaakte oplossing – niet beperkt tot standaard moleculaire descriptors.
Bied je doorlopende ondersteuning of wijzigingen na levering?
Ja, ik bied redelijke revisies binnen de scope van de oorspronkelijke opdracht. Als je extra wijzigingen, uitgebreide ondersteuning of hulp bij het aanpassen van de code voor een andere dataset nodig hebt, kunnen we een kleine extra vergoeding bespreken. Mijn doel is dat je volledig tevreden bent met het eindresultaat.

