Ik analyseer bacteriële en microbiële genomen met bioinformatica

Ik bied wetenschappelijk onderbouwde bioinformatica-analyse van bacteriële genomen, met focus op duidelijke resultaten, reproduceerbaarheid en biologische interpretatie.

Afhankelijk van het gekozen pakket kan de analyse onder meer omvatten:

-- Statistieken over genome-assemblage kwaliteit

-- Beoordeling van volledigheid en contaminatie

-- Genome-annotatie

-- Samenvattingen van genomische kenmerken

-- Vergelijkende genome-analyse

-- Gelijkenis-analyse van genomen

-- Tabellen en wetenschappelijke visualisaties

-- Bondige interpretatie van de resultaten

-- Informatie over methoden en software

Standaardpakketten zijn ontworpen voor al geassembleerde bacteriële genomen, meestal geleverd in FASTA-formaat.

Ruwe sequencing reads, grote genoomcollecties, gespecialiseerde fylogenomische analyses of aangepaste workflows zijn niet automatisch inbegrepen. Neem contact met mij op voordat je bestelt als je project deze analyses vereist.

Elk project wordt beoordeeld op basis van de biologische vraag in plaats van een generieke workflow.