Door categorieën bladeren
Ontdekken
Fiverr Pro
Nederlands
$
USD
Ik voer bulk rnaseq deg en pathway analyse uit
Bioinformatics Genomics R Python ML en Wetenschappelijk Schrijven
Ik ben Saad, een bioinformatics en computationeel biologie specialist gericht op plantengenomics, genome annotatie, RNA-seq, data-analyse, R, Python en wetenschappelijk schrijven. Via Saad Genomics St...
Over deze dienst
Welkom bij mijn GiG,
Ben je op zoek naar nauwkeurige, reproduceerbare en publicatieklare bulk RNA-seq analyse?
Ik bied op maat gemaakte transcriptomische data-analyse voor onderzoekers, laboratoria en biotechnologieprofessionals. Ik kan werken met raw count matrices of FASTQ-bestanden, afhankelijk van het gekozen pakket.
De diensten kunnen onder meer omvatten:
- FASTQ kwaliteit controle en MultiQC rapportage
- Lees trimming, alignering of transcript kwantificatie
- Gene-level count generatie
- Normalisatie, PCA en monsters correlatie
- Differentiële expressie analyse
- Volcano grafieken, MA grafieken en heatmaps
- Gene Ontology en pathway verrijking
- Publicatieklare figuren en resultaat tabellen
- R scripts en een duidelijke interpretatie rapport
Ik gebruik gevestigde tools zoals FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, Salmon, DESeq2, edgeR en clusterProfiler op Linux omgeving.
Neem contact met mij op voordat je bestelt voor raw FASTQ bestanden, niet-model organismen, complexe ontwerpen of meer dan 12 monsters. Resultaten hangen af van data kwaliteit en experimenteel ontwerp.
Mijn portfolio
Veelgestelde vragen
Automatische vertaling
Accepteer je raw FASTQ bestanden?
Ja. FASTQ verwerking is inbegrepen in het Premium pakket of kan worden geleverd via een aangepaste aanbieding. Stuur vooraf het aantal monsters, sequencing type en geschatte bestandsgroottes voordat je bestelt.
Kun je een bestaande count matrix analyseren?
Ja. Geef de raw integer count matrix, sample metadata en de vergelijkingen die je wilt uitvoeren.
Welke organismen kun je analyseren?
Ik kan planten, microbieel, dierlijk en menselijk datasets analyseren wanneer geschikte reference genome, transcriptome en annotatiebronnen beschikbaar zijn.
Lever je publicatieklare figuren?
Ja. Figuren kunnen worden geleverd in PNG, TIFF, PDF of SVG formaat, afhankelijk van je gekozen pakket en publicatievereisten.
Zul je de analyse code leveren?
Analyse scripts zijn inbegrepen in de Standard en Premium pakketten. Ze kunnen ook worden toegevoegd aan het Basic pakket als extra.
Garandeer je significante genen of pathways?
Nee. Resultaten hangen af van data kwaliteit, sequencing diepte, biologische variatie en experimenteel ontwerp. Ik bied transparante analyse zonder resultaten te manipuleren of fabriceren.
